• Descripción de nuevos géneros y especies bacterianas con repercusión clínica.
• Streptococcus pyogenes: elementos genéticos móviles protagonistas en la evolución de serotipos pandémicos M1 y M89 causantes de infecciones invasivas.
• Streptococcus agalactiae: estructura poblacional, distribución de serotipos y resistencia a antimicrobianos en cepas causantes de infección invasiva.
• Filogenia, susceptibilidad y caracterización de mecanismos moleculares de resistencia y plataformas genéticas de Nocardia
• Caracterización de los genotipos circulantes en España de Brucella melitensis e identificación de nuevas líneas clonales.
• Generación del conocimiento de las bacterias anaerobias invasivas mediante su estudio genómico.

- Elementos genéticos móviles protagonistas en la evolución de los serotipos pandémicos M1 y M89 de Streptococcus pyogenes en el síndrome del shock tóxico y en otras infecciones invasivas. IP y coIP: Pilar Villalón y Sylvia Valdezate. Organismo financiador: ISCIII. Convocatoria: AESI 2018. Duración: 1 enero 2019 – 31 diciembre 2022.Financiación: 40000 €. Nº  de Expediente: PI18CIII/00008

- Desvelando la genómica de las bacterias anaerobias procedentes de bacteriemias. IP: Sylvia Valdezate. Organismo financiador: Agencia Estatal de Investigación Convocatoria: Agencia Estatal de Investigación. Generación del Conocimiento. 2021. Duración: 1 septiembre 2022 – 31 agosto 2026. Financiación: 98000 €. Nº de Expediente: PID2021-127477OB-I00

Villalón P., Bárcena M., Medina-Pascual M.J., Garrido N., Pino-Rosa S., Carrasco G., Valdezate S. National Surveillance of Tetracycline, Erythromycin, and Clindamycin Resistance in Invasive Streptococcus pyogenes: A Retrospective Study of the Situation in Spain, 2007–2020. Antibiotics, 2023; 12:1 doi: 10.3390/antibiotics12010099- IF: 4,8/ Infectious diseases/Q2

Valdezate S., Carrasco G., Medina M.J., Garrido N., del Pino S., Valiente M., Pallarés M.P., Villalon P. Exploring the genetic background of the botulism neurotoxin BoNT/B2 in Spain. Microbiology Spectrum 2023; 11:5 doi: 10.1128/SPECTRUM.02380-23 IF: 3,7/Microbiology/Q2

Pino-Rosa S., Medina-Pascual M.J., Carrasco G., Garrido N., Villalón P., Valiente M., Valdezate S. Focusing on Gordonia Infections: Distribution, Antimicrobial Susceptibilities and Phylogeny. Antibiotics 2023; 12:11doi: 10.3390/antibiotics12111568. IF: IF: 4,8 / Infectious Diseases / Q2. IF: 4,8/Iinfectious diseases/Q2

Bellés-Bellés A., Prim N., Mormeneo-Bayo S., Villalón-Panzano P., Valiente-Novillo M., Jover-Sáenz A., Aixalà N., Bernet A., López-González É., Prats I., García-González M. Changes in Group A Streptococcus emm Types Associated with Invasive Infections in Adults, Spain, 2023. Emerging Infectious Diseases 2023 29:11 doi: 10.3201/eid2911.230857 IF: 11,8/Infectious diseases/Q1

Hendrickx D., Varela Martínez C., Contzen M., Wagner-Wiening C., Janke K.-H., Hernando Jiménez P., Massing S., Pichler J., Tichaczek-Dischinger P., Burckhardt F., Stark K., Katz K., Jurke A., Thole S., Carbó R., del Pobil Ferré M.P., Nieto M., Zamora M.J., Sisó A., Pallares García P., Valdezate S., Schaade L., Worbs S., Dorner B.G., Frank C., Dorner M.B. First cross-border outbreak of foodborne botulism in the European Union associated with the consumption of commercial dried roach (Rutilus rutilus). Frontiers in Public Health 2023;10:doi: 10.3389/fpubh.2022.1039770 IF: 5,2/ Public, environmental & occupational health/Q1

Peñuelas M., Guerrero-Vadillo M., Valdezate S., Zamora M.J., Leon-Gomez I., Flores-Cuéllar Á., Carrasco G., Díaz-García O., Varela C. Botulism in Spain: Epidemiology and Outcomes of Antitoxin Treatment, 1997–2019. Toxins 2023; 15:1 doi: 10.3390/toxins15010002. IF: 4,2/Toxicology/Q2

Valdezate S, Cobo F, Monzón S, Medina-Pascual MJ, Zaballos A, Cuesta I, Pino-Rosa S, Villalón P. Genomic background and phylogeny of cfiA-positive Bacteroides fragilis strains resistant to meropenem-EDTA. Antibiotics 2021;10:304. doi: 10.3390/antibiotics10030304. IF: 5,222 / Infectious Diseases / Q2.

Villalón P, Sáez-Nieto JA, Rubio-López V, Medina-Pascual MJ, Garrido N, Carrasco G, Pino-Rosa S, Valdezate S. Invasive Streptococcus pyogenes disease in Spain: a microbiological and epidemiological study covering the period 2007-2019. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2021;40:2295-2303. doi: 10.1007/s10096-021-04279-2. IF: 5,103 / Microbiology / Q2.

Sáez-Nieto JA, Carrasco G, del Pino S, Medina-Pascual MJ, Garrido N, Villalón P, Valdezate S. Identification and antimicrobial susceptibility of Streptomyces and other unusual Actinobacteria clinical isolates in Spain. New Microbe and New Infect 2021;44:100946. doi: 10.1016/j.nmni.2021.100946. IF: no disponible / Microbiology / Q2.

Carrasco G, Monzón S, Sansegundo M, García E, Garrido N, Medina-Pascual MJ, Villalón P, Ramírez A, Jiménez P, Cuesta I, Valdezate S. Molecular characterization and antimicrobial susceptibilities of Nocardia species isolated from the soil. A comparison with species isolated from humans. Microorganisms 2020;8(6):900. doi: 10.3390/microorganisms8060900. IF: 4,926 / Microbiology / Q2.

• Taxonomía polifásica y Taxonomo-genómica, identificación bacteriana mediante el empleo de diferentes dianas moleculares.
• Susceptibilidad a antimicrobianos y estudio molecular de resistencias.
• Espectrometría de Masas (MALDI-TOF).
• Detección molecular de genes de virulencia y toxinas.
• Análisis de secuencias de múltiples locus “MLST”.
• Análisis de secuencia en tándem número variable de múltiples locus “MLVA”.
• Secuenciación del genoma completo.

• Ultracongelador para la conservación de cepas bacterianas.
• Estufa de CO2 y aerofila para cultivos.
• Microscopio óptico y lupa.
• Centrífugas, espectrofotómetro, termocicladores.
• Fuentes de alimentación y cubetas de electroforesis.
• Analizador de imagen.
• Licencia del software LaserGene (Seqman, EditSeq) para actividades de manipulación de ADN y acceso a otros programas Chromas, BioEdit, MEGA, etc.
• Equipo MALDI-TOF VITEK MS.
• Electroforesis en campo pulsado.
• Servicios centralizados del CNM/ISCIII disponibles:
  • Unidad de esterilización y preparación de material: medios de cultivo, autoclaves, dispensadores, protocolos de trabajo.
  • Unidad de Genómica: síntesis de oligonucleótidos, secuenciación Sanger, secuenciación del genoma completo con plataforma Illumina.
  • Unidad de Bioinformática: análisis de la información obtenida por secuenciación del genoma completo.
  • Unidad de Informática: resolución de incidencias informáticas.
  • Oficina de transferencia de resultados de investigación.