Research groups - ENFERMEDADES INFECCIOSAS

Laboratorio de Referencia e Investigación en Taxonomía y Tuberculosis. Unidad de Taxonomía


Investigadores responsables: Silvia Valdezate Ramos. svaldezate@isciii.es, Pilar Villalón Panzano. pvillalon@isciii.es. CNM. ISCIII

Body: Instituto de Salud Carlos III. CNM

Investigadores:

  • Gema Carrasco Díaz. CNM. ISCIII
  • María José Medina Pascual. CNM. ISCIII
  • Pilar Villalón Panzano. CNM. ISCIII
  • Descripción de nuevos géneros y especies bacterianas con repercusión clínica.
  • Streptococcus pyogenes: elementos genéticos móviles protagonistas en la evolución de serotipos pandémicos M1 y M89 causantes de infecciones invasivas.
  • Streptococcus agalactiae: estructura poblacional, distribución de serotipos y resistencia a antimicrobianos en cepas causantes de infección invasiva.
  • Filogenia, susceptibilidad, y caracterización de mecanismos moleculares de resistencia y plataformas genéticas en Nocardia spp.
  • Caracterización de los genotipos circulantes en España de Brucella melitensis e identificación de nuevas líneas clonales.
  • Elementos genéticos móviles protagonistas en la evolución de los serotipos pandémicos M1 y M89 de Streptococcus pyogenes en el síndrome de shock tóxico y en otras infecciones invasivas. AESI.
  • Carrasco G, Monzón S, San Segundo M, García E, Garrido N, Medina-Pascual MJ, Villalón P, Ramírez A, Jiménez P, Cuesta I, Valdezate S. Molecular Characterization and Antimicrobial Susceptibilities of Nocardia Species Isolated from the Soil; A Comparison with Species Isolated from Humans. Microorganisms. 2020;8(6):900. doi: 10.3390/microorganisms8060900. IF:  152 / Microbiology / Q2.
  • Medina-Pascual MJ, Monzón S, Villalón P, Cuesta I, González-Romo F, Valdezate S. Saezia sanguinis gen. nov., sp. nov., a Betaproteobacteria member of order Burkholderiales, isolated from human blood. Int J Syst Evol Microbiol. 2020;70(3):2016-2025. doi: 10.1099/ijsem.0.004010. IF: 2.166 / Microbiology / Q3.
  • Villalón P, Ortega M, Sáez-Nieto JA, Carrasco G, Medina-Pascual MJ, Garrido N, Valdezate S. Dynamics of a Sporadic Nosocomial Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii Complex Population. Front Microbiol. 2019;10:593. doi: 10.3389/fmicb.2019.00593. IF: 4.235 / Microbiology / Q2.
  • Sáez-Nieto JA , Medina-Pascual  MJ, Carrasco G, Garrido N, Fernandez-Torres  MA, Villalón P, Valdezate S. Paenibacillus spp. isolated from human and environmental samples in Spain: detection of 11 new species. New Microbes New Infect. 2017;19:19-27. doi: 10.1016/j.nmni.2017.05.006. No indexada.
  • Valdezate S, Garrido N, Carrasco G, Medina-Pascual MJ, Villalón P, Navarro AM, Saéz-Nieto JA. Epidemiology and susceptibility to antimicrobial agents of the main Nocardia species in Spain. J Antimicrob Chemother. 2017;72(3):754-761. doi: 10.1093/jac/dkw489. IF: 5.217 / Infectious Diseases / D1.
  • Taxonomía polifásica y Taxonomo-genómica, identificación bacteriana mediante el empleo de diferentes dianas moleculares.
  • Susceptibilidad a antimicrobianos y estudio molecular de resistencias.
  • Espectrometría de Masas (MALDI-TOF).
  • Detección molecular de genes de virulencia y toxinas.
  • Análisis de secuencias de múltiples locus “MLST”.
  • Análisis de secuencia en tándem número variable de múltiples locus “MLVA”.
  • Secuenciación del genoma completo.
  • Ultracongelador para la conservación de cepas bacterianas.
  • Estufa de CO2 y aerofila para cultivos.
  • Microscopio óptico y lupa.
  • Centrífugas, espectrofotómetro, termocicladores.
  • Fuentes de alimentación y cubetas de electroforesis.
  • Analizador de imagen.
  • Licencia del software LaserGene (Seqman, EditSeq) para actividades de manipulación de ADN y acceso a otros programas Chromas, BioEdit, MEGA, etc.
  • Equipo MALDI-TOF VITEK MS.
  • Electroforesis en campo pulsado.
  • Servicios centralizados del CNM/ISCIII disponibles:
    • Unidad de esterilización y preparación de material: medios de cultivo, autoclaves, dispensadores, protocolos de trabajo.
    • Unidad de Genómica: síntesis de oligonucleótidos, secuenciación Sanger, secuenciación del genoma completo con plataforma Illumina.
    • Unidad de Bioinformática: análisis de la información obtenida por secuenciación del genoma completo.
    • Unidad de Informática: resolución de incidencias informáticas.
    • Oficina de transferencia de resultados de investigación.