Nuestras líneas de investigación se centran en Hepatitis C (VHC), Virus de Inmunodeficiencia Humana (VIH) y Virus Respiratorio Sincitial (VRS):

• Inmunopatogenia de la hepatitis C.

• Impacto de la eliminación del VHC con tratamiento antiviral.

• Resistencia a la infección por VHC y aclaramiento espontáneo.

• Cribado de hepatitis C activa y epidemiología molecular del VHC.

• Anticuerpos neutralizantes de amplio espectro frente al VHC.

• Regulación de la respuesta inmune innata frente al VRS.

• Impacto de la metagenómica y metabolómica en infección por VHC y VIH.

• Biopsia líquida y transcriptómica como biomarcadores en hepatopatía y senescencia por VHC.

Impacto a largo plazo de la eliminación del VHC en la infección VIH: integración de marcadores inmuno-virológicos del VIH, transcriptoma del hospedador y microbioma plasmático. IPs: Verónica Briz Sebastián / Amanda Fernández Rodríguez. Organismo financiador: Ministerio de Ciencia e Innovación. Convocatoria: Proyectos de Generación de Conocimiento 2021. Financiación: 157.300 €.  Duración:  Septiembre 2022 - agosto 2025. Nº de Expediente: PID2021-126781OB-I00

CIBER de Enfermedades Infecciosas. IP: Salvador Resino. Organismo financiador: ISCIII - Fondo de Investigación Sanitaria (FIS). Convocatoria: AES 2021. Financiación: 300.000 €. Duración: 2022-2026 (5 años). Nº de Expediente: CB21/13/00044.

Infecciones agudas/recientes y reinfecciones por VHC en hombres que tienen sexo con hombres con y sin VIH. IP: Salvador Resino. Organismo financiador: ISCIII - Fondo de Investigación Sanitaria (FIS). Convocatoria: AESI 2020. Financiación: 78.000 €. Duración: 2021-2023. Nº de Expediente: PI20CIII/00004

Evaluation of the impact of the linkage-to-care as an alternative method for hepatitis C screening in PWID. IP: Salvador Resino. Organismo financiador: Gilead Sciences, Inc. Financiación: 25.000 €. Duración: 2022-2025. Nº de Expediente: GLD20_0144.

Análisis multi-ómico para evaluar el impacto a largo plazo de la erradicación del VHC en pacientes coinfectados por VIH/VHC con cirrosis. IP: María Ángeles Jiménez Sousa. Organismo financiador: ISCIII - Fondo de Investigación Sanitaria (FIS). Convocatoria: AESI 2021. Financiación: 92.000 €. Duración:  2022-2024. Nº de Expediente: PI21CIII/00033.

Desarrollo de un ensayo de diagnóstico rápido para el cribado de la infección activa del virus de la hepatitis C basado en la detección del "core". IP: Isidoro Martínez González. Organismo financiador: ISCIII - Fondo de Investigación Sanitaria (FIS). Convocatoria: AESI 2019. Financiación 53.000 €. Duración: 2020-2022.  Nº de Expediente: PI19CIII/00009.

Título del proyecto: Nanosistemas dendríticos aplicados al diagnóstico de infecciones virales. IP: Daniel Sepúlveda Crespo/Isidoro Martínez González. Organismo Financiador: ISCIII - Fondo de Investigación Sanitaria (FIS).  Convocatoria: AESI 2023. Financiación: 137.000 euros. Duración: 2024-2026 (3 años).Expediente: PI23CIII/00018.

Título del proyecto: Optimización de la duración del tratamiento antibiótico en la sepsis abdominal basado en la cinética de biomarcadores transcriptómicos y clínicos (Estudio GENOTIME-COHORT). IP: Amanda Fernández Rodríguez. Organismo Financiador: ISCIII - Fondo de Investigación Sanitaria (FIS). Convocatoria: AESI 2023. Financiación: 153.000 euros. Duración: 2024-2026 (3 años). Expediente: PI23CIII/00010.

Título del proyecto: Algoritmo predictivo para aNTicipar una retIrada preCoz y segura del tratamiento AntIbiótico en sePsis Abdominal basado en marcadores clínicos y transcriptómicos. IP: Amanda Fernández Rodríguez. Organismo Financiador: Convocatoria de Proyectos CIBERINFEC intramurales. Convocatoria:  2023. Financiación: 120.000 euros. Duración: 2024-2025 (2 años). Código: IM23/INFEC/1.

Título del proyecto: Biomarcadores en lavado broncoalveolar para el diagnóstico y la predicción evolutiva de la aspergilosis pulmonar invasora. IP: María Ángeles Jiménez Sousa. Organismo Financiador: Convocatoria de Proyectos CIBERINFEC intramurales. Convocatoria:  2023. Financiación: 63.000 euros. Duración: 2024-2025 (2 años). Código: IM23/INFEC/7.

1. Martín-Escolano R, Vidal-Alcántara EJ, Crespo J, Ryan P, Real LM, Lazo-Álvarez JI, Cabezas-González J, Macías J, Arias-Loste MT, Cuevas G, Virseda-Berdices A, Briz V, Resino S (‡), Jiménez-Sousa MÁ (‡), Fernández-Rodríguez A (‡). Immunological and senescence biomarker profiles in patients after spontaneous clearance of hepatitis C virus: gender implications for long-term health risk. Immun Ageing.2023, 20(1):62. (A; FI= 7.9; D1, Geriatrics & Gerontology; JCR 2022). PMID: 37978401. DOI: 10.1186/s12979-023-00387-z.
2. Berenguer J, Jarrín I, Bellón JM, Díez C, Jiménez-Sousa MA, Roca C, González-García J, Dalmau D, Olalla J, Herrero C, Villarroya F, Domingo P, Resino S. Obesity-related SNPs and weight gain following first-line antiretroviral therapy. Clin Inf Dis. 2023; 76(6):977-985. (A; FI= 11.8; D1, Infectious Diseases; JCR 2022). PMID: 36345912. DOI: 10.1093/cid/ciac880.
3. Virseda-Berdices A, Concostrina-Martinez L, Martínez-González O, Blancas R, Resino S, Ryan P, De Juan C, Moreira-Escriche P, Martin-Vicente M, Brochado-Kith O, Blanca-López N, Jiménez-Sousa MA ^(‡,*), Fernández-Rodríguez A ^(‡). Relative telomere length impact on mortality of COVID-19: sex differences. J Med Virol 2023; 95(1):e28368 (A; FI= 12.7; D1, Virology; JCR 2022). PMID: 36458548. DOI: 10.1002/jmv.28368.
4. Pérez-García F, Vázquez-Morón S, Burgueño-García I, Muñoz-Gómez MJ, Zea-Sevilla MA, Calero M ^(‡), Rábano A ^(‡), Martínez I ^(‡), Resino S ^(*‡). Hepatitis E virus seroprevalence is associated with neurodegenerative disorders in older people with dementia: a case-control study. J Infect Dis 2023; 227(7):873-877 (A; FI= 6.4; Q1, Infectious Diseases; JCR 2022). PMID: 35759220. DOI: 10.1093/infdis/jiac268.
5. Sepúlveda-Crespo D, Yélamos MB, Díez C, Gómez J, Hontañón V, Torresano-Felipe F, Berenguer J, González-García J, Ibañez-Samaniego L, Llop E, Olveira A, Martínez J, Resino S ^{(‡ *)}, Martínez I ^{(‡ *)}. Negative impact of HIV infection on broad-spectrum anti-HCV neutralizing antibody titers in HCV-infected patients with advanced HCV-related cirrhosis. Biomed Pharmacother 2022, 150: 113024. (A; FI= 7.42; D1, Pharmacology & Pharmacy; JCR 2021). PMID: 35483197. DOI: 10.1016/j.biopha.2022.113024.
6. Pérez-García F, Martin-Vicente M, Rojas-García RL, Castilla-García L, Muñoz-Gomez MJ, Hervás-Fernández I, González-Ventosa V, Vidal-Alcántara EJ, Cuadros-González J, Bermejo-Martin JF ^(‡), Resino S ^{(‡ *)}, Martínez I ^(‡). High SARS-CoV-2 Viral Load and Low CCL5 Expression Levels in the Upper Respiratory Tract Are Associated With COVID-19 Severity. J Infect Dis 2022; 225(6):977-982 (A; FI= 6.4; Q1, Infectious Diseases; JCR 2022). PMID: 34910814. DOI: 10.1093/infdis/jiab604..
7. Fernández-Pato A; Virseda-Berdices A, Ryan P; Martínez-González O, Peréz-García F, Resino S, Martin-Vicente M, Valle-Millares D, Brochado-Kith O; Blancas R; Ceballos FC; Bartolome-Sánchez S; Vidal-Alcántara EJ; Alonso-Menchén D, Blanca-López N; Ramirez Martinez-Acitores I, Rava M, Jiménez-Sousa MA ^{(‡ *)}, Amanda Fernández-Rodríguez ^{(‡ *)}. Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality. Emerg Microbes Infect 2022; 11(1):676-688 (A; FI= 13.2; D1, Infectious Diseases; JCR 2021). PMID: 35130828. DOI: 10.1080/22221751.2022.2038021.
8. Berenguer J ^(*), Díez C, Martín-Vicente M, Mican R, Pérez-Elías MJ, García-Fraile LJ, Vidal F, Suárez-García I, Podzamcer D, Del Romero J, Pulido F, Iribarren JA, Gutiérrez F, Poveda E, Galera C, Izquierdo R, Asensi V, Portilla J, López JC, Arribas JR, Moreno S, González-García J, Resino S ^(‡), Jarrín I ^(‡). Prevalence and factors associated with SARS-CoV-2 seropositivity in the Spanish HIV Research Network Cohort. Clin Microbiol Infect. 2021, 27(11):1678-1684. (A; FI= 13.31; Q1, Infectious Diseases; JCR 2021). PMID: 34186209 DOI: 10.1016/j.cmi.2021.06.023.
9. Brochado O, Martínez I ^(*), Berenguer J, Medrano L, González-García J, Jiménez-Sousa MA, Carrero A, Hontañón V, Navarro J, Guardiola JM, Pérez-Latorre L, Micán R, Fernández-Rodríguez A ^(‡), Resino S ^{(* ‡)}. HCV eradication with IFN-based therapy does not completely restore gene expression in PBMCs from HIV/HCV-coinfected patients. J Biomed Sci 2021; 28:23 (A; FI= 12.77; D1, Medicine, Research & Experimental; JCR 2021). PMID: 33785040. DOI: 10.1186/s12929-021-00718-6.
10. Brochado-Kith O, Martínez I, Berenguer J, González-García J, Salgüero S, Sepúlveda-Crespo D, Díez C, Hontañón V, Ibañez-Samaniego L, Pérez-Latorre L, Fernández-Rodríguez A ^(‡), Jiménez-Sousa MA ^(‡), Resino S ^{(‡ *)}. HCV cure with direct-acting antivirals improves liver and immunological markers in HIV/HCV-coinfected patients. Front immunol. 2021; 12:723196. (A; FI= 8.79; Q1, Immunology; JCR 2021). PMID: 34497613. DOI: 10.3389/fimmu.2021.723196.

• Análisis genómico, principalmente genotipado de polimorfismos genéticos de un solo nucleótido (SNPs), pero también analizamos el nivel de expresión de distintos tipos de RNA en células de sangre periférica y en exosomas por medio de la secuenciación masiva y PCR en tiempo real.

• Análisis de biomarcadores en sangre periférica vía ELISA multiplex, espectrometría de masas (metabolómica) y citometría de flujo.

• Análisis estadístico y bioinformático de datos.

• Cribado y secuenciación del VHC para estudios de epidemiología molecular.

• Caracterización de anticuerpos frente a infecciones virales mediante ELISA, ensayos de neutralización y resonancia de plasmones superficiales (Biacore).

• Modulación de la expresión de genes celulares mediante silenciamiento con siRNAs, transfección con plásmidos, y generación de células “knockout” para analizar su efecto en la replicación viral y la respuesta inmune innata temprana a la infección.

La Unidad de Infección Viral e Inmunidad cuenta con un laboratorio con el equipamiento básico para la manipulación y análisis de muestras biológicas de pacientes y el cultivo de virus infectivos humanos, incluidos 4 termocicladores de PCR, 2 termocicladores de PCR en tiempo real, 2 cabinas de PCR, 5 cabinas de bioseguridad para procesar muestras biológicas, 4 incubadores de CO2, 2 microscopios invertidos, 5 congeladores de -4ºC y -20ºC, 3 ultracongelador de -80ºC, cámaras refrigeradoras, centrífugas, campanas de gases, agitadores, baños, termobloques, sistemas de electroforesis de ácidos nucleicos y proteínas, espectrofotómetro, etc.