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Research groups - ENFERMEDADES INFECCIOSAS

Laboratorio de Referencia e Investigación en Infecciones Bacterianas Inmunoprevenibles. Unidad de Genética Bacteriana.

Investigador responsable: Adela González de la Campa. agcampa@isciii.es. CNM. ISCIII

Body: Instituto de Salud Carlos III. CNM

Investigadores:

  • Mónica Amblar Esteban. CNM. ISCIII
  • María José Ferrándiz Avellano. CNM. ISCIII
  • Identificación de los factores que estabilizan la topología del cromosoma: proteínas de unión al nucleoide, ncRNAs, interacciones intracromosómicas.
  • Regulación de la transcripción en respuesta a estrés topológico: localización in vivo de DNA topoisomerasas, RNA polimerasa y proteínas de unión al nucleoide.
  • Fluoroquinolonas: bombas de eflujo y efecto post-antibiótico.
  • Papel del DNA estructural en recombinación.
  • DNA topoisomerasa I como nueva diana antimicrobiana y acción de la seconeolitsina.
  • Diseño de RNAs antisentido y utilización del sistema CRISPR como nuevos agentes antibacterianos.

Interacción entre superenrollamiento del DNA y la transcripción en el patógeno humano Streptococcus pneumoniae

MCIN/AEI/10.13039/501100011033/FEDER, UE

PID2021-124738OB-100. 2022-2025

Investigador Principal: Adela González de la Campa

  1. García-López M, Hernández P, Megias D, Ferrándiz MJ*, de la Campa AG*. Physiologic and transcriptomic effects triggered by overexpression of wild type and mutant DNA topoisomerase I in Streptococcus pneumoniae. Int J Mol Sci. (2023) 24:15800. FI: 5.6, Q1. doi: 10.3390/ijms242115800.
  2. García-López M, Megias D, Ferrándiz MJ*, de la Campa AG*. The balance between gyrase and topoisomerase I activities determines levels of supercoiling, nucleoid compaction, and viability in bacteria. Front Microbiol. (2023) 11;1094692. FI: 5.2, Q2 doi: 0.3389/fmicb.2022.1094692.
  3. de Vasconcelos Junior AA, Tirado-Vélez JM, Martín-Galiano AJ, Megias D, Ferrándiz MJ, Hernández P, Amblar M*, de la Campa AG*. StaR Is a positive regulator of topoisomerase I activity involved in supercoiling maintenance in Streptococcus pneumoniae. Int J Mol Sci. (2023) 24:5973. FI: 5.6, Q1. doi: 10.3390/ijms24065973
  4. Ferrándiz M-J, Hernández P, de la Campa AG*. Genome-wide proximity between RNA polymerase and DNA topoisomerase I supports transcription in Streptococcus pneumonia. PLoS Genet. 17:e1009542 (2021). FI: 6.020, Q1. doi: 10.1371/journal.pgen.1009542.
  5. Tirado-Vélez JM, Carreño D, Sevillano D, Alou L, Yuste J*, de la Campa AG*. Seconeolitsine, the novel inhibitor of DNA topoisomerase I, protects against invasive pneumococcal disease caused by fluoroquinolone-resistant strains. Antibiotics 10:573 (2021). FI: 5.222, Q1.  doi:10.3390/antibiotics10050573
  6. Martín-Galiano AJ*, Escolano-Martínez MS, Corsini B, de la Campa AG, Yuste J*. Immunization with SP_1992 (DiiA) protein of Streptococcus pneumoniae reduces nasopharyngeal colonization and protects against Invasive disease in mice. Vaccines 9:187 (2021). FI: 4.961, Q2.  doi:10.3390/vaccines9030187
  7. Acebo P, Herranz C, Espenberger LB, Gómez-Sanz A, Terrón MC, Luque D, Amblar M*. A small non-coding RNA modulates expression of Pilus-1 type in Streptococcus pneumoniae. 9:1883. (2021). FI: 4.78, Q2. doi: 10.3390/microorganisms9091883.
  8. Valenzuela MV, Domenech M, Mateos-Martínez P, González-Camacho F, de la Campa AG*, García MT*. Antibacterial activity of a DNA topoisomerase I inhibitor versus fluoroquinolones in Streptococcus pneumoniae. PloS One. 15(11):e0241780 (2020). FI: 3.204, Q2. doi: 10.1371/journal.pone.024178.
  9. Sánchez-Tarjuelo R, Cortegano I; Manosalva J, Rodriguez M, Ruiz C, Alía M, Prado MC, Cano EM, Ferrándiz MJ, de la Campa AG, Gaspar ML*, de Andrés B*.The TLR4-MyD88 signaling axis regulates lung monocyte differentiation pathways in response to Streptococcus pneumoniae. Front Immunol 11 (2020). FI: 7.561, Q1. doi: 10.3389/fimmu.2020.02120
  10. García MT, Valenzuela MV, Ferrándiz MJ, de la Campa AG*. Reactive Oxygen Species Production is a Major Factor Directing the Post-antibiotic Effect of Fluoroquinolones in Streptococcus pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother. 63:e00737-19 (2019). FI: 4.904, Q1. doi: 10.1128/AAC.00737-19
  • Manipulación genética de bacterias. Clonación de genes en plásmidos.
  • Estudio del nivel de superenrollamiento mediante electroforesis bidimensional de plásmidos.
  • Análisis de expresión génica. Estudio del transcriptoma por RNAseq y RtPCR. Estudio del proteoma.
  • Inmunoprecipitación de cromatina (ChiPSeq).
  • Equipamiento básico de un laboratorio de microbiología y biología molecular.
  • Cabinas de flujo laminar.
  • Equipos de RtPCR.
  • Lector de placas termostatizado.
  • Sistema FPLC de purificación de proteínas.