• Desarrollo y validación de métodos celulares y moleculares para la detección y caracterización de virus entéricos.
• Vigilancia microbiológica y epidemiológica de las infecciones causadas por poliovirus y enterovirus no-polio. Laboratorio Nacional de Referencia para WHO.
• Investigación en infecciones por enterovirus y parechovirus que causan patologías neurológicas y sistémicas en población pediátrica.
• Investigación y vigilancia de las infecciones víricas que causan gastroenteritis.
• Detección de virus entéricos y SARS-CoV-2 en muestras ambientales (aguas residuales) como método de vigilancia y de excreción por parte de la población.
• Aplicación de la secuenciación masiva para el diagnóstico de infecciones neurológicas de origen vírico.

• Investigación de las infecciones neurológicas graves en niños causadas por enterovirus emergentes en España: EV-A71 y EV-D68. IP: María Cabrerizo. Colaborador externo: Dolores Fernández García. Financiación: ISCIII-AESI 42.500 €. Duración: 01/01/2019-30/06/2023. Nº de expediente: PI18CIII/00017
• Paving the way for implementing a syndromic diagnostic scheme at the CNM for the diagnosis of diarrhoea-causing pathogens in stool samples based on molecular and metagenomics methods IP: David Carmena. Colaborador externo: María Cabrerizo. Financiación: ISCIII-AESI 93.200 €. Duración: 01/01/2020-31/12/2022. Nº de expediente: PI19CIII/00029
• Metagenomic sequencing to identify viral etiologies in undiagnosed cases of meningitis and encephalitis. IP: Dolores Fernández-García. Colaborador externo: María Cabrerizo. Organismo financiador: ISCIII-AESI Financiación: 52.000 €. Duración: 31/12/2020-31/12/2023. Nº de expediente:PI20CIII/00005
• Metagenomic sequencing to identify viral aetiologies in undiagnosed paediatric cases of meningitis and encephalitis IP: C. Launes/ D. Tarragó. Investigadoras colaboradoras:  María Cabrerizo, Dolores Fernández-García. Financiación: CIBERESP 49.800€. Duración: 01/01/2021-31/12/2022. Nº de expediente: CIBERESP21/P9.
• Investigación de las infecciones por enterovirus que causan enfermedades neurológicas y respiratorias graves en niños. Vigilancia molecular y serológica de los tipos emergentes. IP: María Cabrerizo. Colaborador externo: Dolores Fernández García. Organismo financiador: ISCIII-AESI. Financiación: 42.000 €. Duración: 01/01/2023-31/12/2025. Nº de expediente PI22CIII/00035.
• Desarrollo de un método de secuenciación masiva para la detección de mutaciones de resistencia a antivirales en citomegalovirus en pacientes receptores de trasplante de células hematopoyéticas.  IP: David Tarragó. Colaborador externo: Dolores Fernández García.  Financiación: ISCIII-AESI 65.000 €. Duración: 01/01/2022-31/12/2024. Nº de expediente: PI21CIII/0011                         

Fernandez-Garcia MD*, Romain Volle, Marie-Line Joffret, Serge Alain Sadeuh-Mba, Ionela Gouandjika-Vasilache, Ousmane Kebe, Michael. R Wiley, Manasi Majumdar, Etienne Simon-Loriere, Anavaj Sakuntabhai, Gustavo Palacios, Javier Martin, Francis Delpeyroux, Kader Ndiaye, Maël Bessaud. Genetic characterization of Enterovirus A71 circulating in Africa. Emerg Infect Dis. 2018; 24:754-757.

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• Cultivo celular para crecimiento de virus.
• Inmunofluorescencia.
• Titulación viral y microneutralización. Serotipificación.
• Métodos de extracción y concentración de virus en muestras clínicas y ambientales (aguas).
• Métodos moleculares de detección y genotipado de virus en muestras clínicas y ambientales (aguas): RT-PCR convencional y a tiempo real.
• Secuenciación fragmentos cortos, de genomas completos y secuenciación masiva.
• Análisis de secuencias y análisis filogenéticos de virus.
• Análisis de datos clínicos y epidemiológicos de enfermedades víricas.

• Laboratorios de cultivo celular (cabinas BSL-2, estufas, microscopios).
• Laboratorios de PCR (cabinas BSL-2, termocicladores convencionales y tiempo real, extractores automáticos).
• Laboratorio de procesamiento de aguas (centrífugas, sistemas de filtración y concentración).