Grupos de investigación - PLATAFORMAS CIENTÍFICO-TÉCNICAS

Unidades Centrales Científico-Técnicas. Microbiología Estructural


Página web del grupo: https://www.isciii.es/QueHacemos/Investigacion/EnfermedadesInfecciosas/Paginas/Detalle.aspx?ItemId=7

Investigador responsable: Daniel Luque Buzo. dluque@isciii.es

Entidad: Instituto de Salud Carlos III. UCCTs.

Investigadores:

  • Carlos Pérez Mata. UCCTs. ISCIII
  • Esperanza Pérez Pastrana. UCCTs. ISCIII
  • Martin Sasche. UCCTs. ISCIII
  • María del Carmen Terrón Orellana. UCCTs. ISCIII

La Unidad estudia de la interacción de diferentes microorganismos con el complejo sistema de membranas celular. En colaboración con diferentes grupos el laboratorio estudia este fenómeno en diferentes sistemas como:

  • Rotavirus, el principal agente causal de diarrea severa en niños menores de 5 años.
  • Virus Respiratorio Sincitial (RSV) y Metaneumovirus (MPV), paramixovirus que producen infecciones del tracto respiratorio inferior.
  • Circovirus, uno de los virus icosaédricos más pequeños y simples que se conoce que se replican de forma autónoma en los vertebrados.
  • Babesia divergens, un patógeno protozoaria que infecta eritrocito y provoca la babebiosis.


Este conocimiento es la base tanto para el desarrollo de nuevos tratamientos para estos patógenos como para el desarrollo de herramientas biotecnológicas basadas en los mismos.

Interacciones virus-huesped en especies de rotavirus no-A y su prevalencia en infecciones humanas. IP: Daniel Luque. Organismo financiador Proyectos de Investigación en Salud-ISCIII. AESi-ISCIII. Financiación: 78.000 €. Duración: 2021-2023. Nº de Expediente: PI20CIII/00014

 

Understanding novel viral host interactions that modulate innate immunity. IPs: Jade Forwood, Subhash Vasudevan, Christopher Basler, Leon Caly, Martin Pal, Daniel Luque, David Aragao. Coordinador: Jade Forwood. Organismo financiador/Convocatoria: National Health and Medical Research Council (NHMRC). 2020 Ideas Grant. Financiación: 764.246$. Duración: 2021-2024. Nº de Expediente: AppId 2003636

 

Functional and structural analysis of flaviviral NS5 protein and its impact on pathogenesis. PI: Prof. Subhash Vasudevan. CI: Daniel Luque. Organismo financiador: National Medical Reserach Council (NMRC) Singapore. Financiación:  1.112.000$ (SGD). Duración: 2019-2022. Nº de Expediente: MOH-000086-00

  1. Luque D, Goulas T, Mata CP, Mendes SR, Gomis-Rüth FX, Castón JR. 2022. Cryo-EM structures shows mechanisitics basis of pan-peptidase inhibition by human α2-macroglobulin. Proc Natl Acad Sci U S A 119(19):e2200102119.

 

  1. Yang, J. Park, M. Koehler, J. Simpson, Luque D, J. M. Rodríguez, Alsteens. 2021. Rotavirus Binding to Cell Surface Receptors Directly Recruiting α2 Integrin. Adv. Nanobiomed Res. 2021000777.

 

  1. Nath BK, Das S, Roby JA, Sarker S, Luque D, Raidal SR, Forwood JK. 2021. Structural Perspectives of Beak and Feather Disease Virus and Porcine Circovirus Proteins. Viral Immunol. 34(1):49-59. doi: 10.1089/vim.2020.0097.

 

  1. Conesa JJ, Sevilla E, Terrón MC, González LM, Gray J, Pérez-Berná AJ, Carrascosa JL, Pereiro E, Chichón FJ, Luque D*, Montero E. 2020. Four-Dimensional Characterization of the Babesia divergens Asexual Life Cycle, from the Trophozoite to the Multiparasite Stage. mSphere. 5(5):e00928-20. *Corresponding author.

 

  1. Luque D. and Castón JR. 2020. Cryo-electron microscopy for the study of viral assembly. Nat Chem. Biol. 16(3):231-239.

 

  1. Rodríguez J.M., Luque D.* 2019. Structural insights into Rotavirus entry. Adv Exp Med Biol. 1140:45-68. *Corresponding author.

 

  1. de Ruiter M.V., Klem R., Luque D., Cornelissen J.J.L.M., Castón JR. 2019. Structural nanotechnology: three-dimensional cryo-EM and its use in the development of nanoplatforms for in vitro catalysis. 11(10):4130-4146.

 

  1. Luque D., Mata C.P., Suzuki N., Ghabrial S.A., Castón J.R. 2018. Capsid structure of dsRNA fungal viruses. Viruses 10(9):481 DOI: 10.3390/v10090481.

 

  1. Jiménez-Zaragoza M., Yubero M.L., Martín-Forero E.,  Castón J.R., Reguera D., Luque D.*, de Pablo P.J., Rodríguez J.M. 2018. Biophysical properties of single rotavirus particles account for the functions of protein shells in a multilayered virus. eLife 7: e37295. *Corresponding author.

 

  1. Olmedillas E., Cano O., Martínez I., Luque D., Terrón M.C., McLellan J.S., Melero J.A., Más V. 2018. Chimeric Pneumoviridae fusion proteins as immunogens to induce cross-neutralizing antibody responses. EMBO Mol Med. 12(9):e1005859.

La Unidad centra su actividad en la aplicación combinada de métodos de microscopía electrónica y procesamiento de imagen en conjunción con técnicas de biología molecular para la comprensión de las relaciones estructura-función que median la biología de diferentes patógenos. En este contexto, la aplicación de los métodos de criomicroscopía electrónica (crioME) permite la visualización directa de ensamblados macromoleculares en su conformación nativa. La combinación de la crioME con métodos de procesamiento de imágenes permite obtener una visión muy detallada de la organización estructural de numerosas macromoléculas y agregados supramoleculares en tres dimensiones. la biología celular y estructural ya que facilita la comprensión de la estructura atómica en su contexto biológico.

  • Microscopio Electrónico TEM FEI Tecnai 12 con filamento de LaB6 operado a 120 kV y dotado con cámara CMOS FEI Ceta (4kx4k). El equipo permite la realización de técnicas convencionales de microscopía, crioME y tomografía electrónica.
  • Criomicroscopio electrónico TEM/STEM Themofisher scientific Talos con cañón de emisión de campo (FEG) y equipado con detector directo de electrones Falcon III. El equipo permite la adquisición manual o automática de datos de crioME de alta resolución, criotomografía electrónica, tomografía TEM/STEM. (El equipo será instalado en Septiembre de 2020).
  • Microscopio Confocal Leica TCS SP5 equipado con 8 líneas laser y 4 canales espectrales de detección simultánea.
  • Equipo de criofijación automática Leica EM GP2.
  • Equipo de criofijación automática Thermofisher scientific Vitrobot Mark IV.
  • Equipo de criosustitución automática Leica EM AFS2.
  • Ultramicrotomo Leica
  • Ultramicrotomo LKB 2128 Ultratome.