Grupos de investigación - PLATAFORMAS CIENTÍFICO-TÉCNICAS

Unidades Centrales Científico-Técnicas. Microbiología Estructural


Página web del grupo: https://www.isciii.es/QueHacemos/Investigacion/EnfermedadesInfecciosas/Paginas/Detalle.aspx?ItemId=7

Investigador responsable: Daniel Luque Buzo. dluque@isciii.es

Entidad: Instituto de Salud Carlos III. UCCTs.

Investigadores:

  • Dunia Asensio Cob. UCCTs. ISCIII
  • Clara Martín de las Heras. UCCTs. ISCIII
  • Esperanza Pérez Pastrana. UCCTs. ISCIII
  • María Josefa Rodríguez Gómez. UCCTs. ISCIII
  • María del Carmen Terrón Orellana . UCCTs. ISCIII
  • Amparo Vivo Rodríguez. UCCTs. ISCIII

La Unidad estudia de la interacción de diferentes microorganismos con el complejo sistema de membranas celular. En colaboración con diferentes grupos el laboratorio estudia este fenómeno en diferentes sistemas como:

  • Rotavirus, el principal agente causal de diarrea severa en niños menores de 5 años.
  • Virus Respiratorio Sincitial (RSV) y Metaneumovirus (MPV), paramixovirus que producen infecciones del tracto respiratorio inferior.
  • Circovirus, uno de los virus icosaédricos más pequeños y simples que se conoce que se replican de forma autónoma en los vertebrados.
  • Babesia divergens, un patógeno protozoaria que infecta eritrocito y provoca la babebiosis.


Este conocimiento es la base tanto para el desarrollo de nuevos tratamientos para estos patógenos como para el desarrollo de herramientas biotecnológicas basadas en los mismos.

  • Functional and structural analysis of flaviviral NS5 protein and its impact on pathogenesis. National Medical Reserach Council (NMRC) Singapore. IP: Prof. Subhash Vasudevan. CI: Dr. Daniel Luque.
  • Near-atomic structural analysis of nanomachines and macromolecular assemblies by the Spanish cryo-EM community. Block Allocation Group (BAG) financiado por iNext para el acceso al Electron Bio-Imaging Center (eBIC) (Diamond Synchrotron - United Kingdom). Coordinador: José R. Castón. IP: Daniel Luque.
  • Luque D, Castón JR. Cryo-electron microscopy for the study of virus assembly. Nat Chem Biol. 2020;16(3):231-239. doi: 10.1038/s41589-020-0477-1. IF:  12,154 / BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY / D1.
  • Rodríguez JM, Luque D. Structural insights into Rotavirus entry. Adv Exp Med Biol. 2019;1140:45-68. doi: 10.1007/978-3-030-14741-9_3. IF: 2,126 / BIOLOGY / Q2.
  • Jiménez-Zaragoza M, Yubero ML, Martín-Forero E, Castón JR, Reguera D, Luque D*, de Pablo PJ*, Rodríguez JM.* 2018. Biophysical properties of single rotavirus particles account for the functions of protein shells in a multilayered virus. eLife 7: e37295. *Co-corresponding authors. IF: 7,551 /  BIOLOGY  / D1.
  • Luque D, Mata CP, González-Camacho F, González JM, Gómez-Blanco J, Alfonso C, Rivas G, Havens WM, Kanematsu S, Suzuki N, Ghabrial SA, Trus BL, Castón JR. Heterodimers as the structural unit of the T=1 capsid of the fungal dsRNA Rosellinia necatrix quadrivirus 1. J Virol. 2016;90(24):11220-11230. doi: 10.1128/JVI.01013-16. IF:  4,663 / VIROLOGY / Q1.
  • Sarker S, Terrón MC, Khandokar Y, Aragão D, Hardy JM, Radjainia M, Jiménez-Zaragoza M, de Pablo PJ, Coulibaly F, Luque D, Raidal DR, Forwood JK. 2016; Structural Insights into the Assembly and Regulation of Distinct Viral Capsid Complexes. Nat. Commun. 2016;7:13014. doi: 10.1038/ncomms13014. IF:   12,124 /  MULTIDISCIPLINARY SCIENCES / D1.

La Unidad centra su actividad en la aplicación combinada de métodos de microscopía electrónica y procesamiento de imagen en conjunción con técnicas de biología molecular para la comprensión de las relaciones estructura-función que median la biología de diferentes patógenos. En este contexto, la aplicación de los métodos de criomicroscopía electrónica (crioME) permite la visualización directa de ensamblados macromoleculares en su conformación nativa. La combinación de la crioME con métodos de procesamiento de imágenes permite obtener una visión muy detallada de la organización estructural de numerosas macromoléculas y agregados supramoleculares en tres dimensiones. la biología celular y estructural ya que facilita la comprensión de la estructura atómica en su contexto biológico.

  • Microscopio Electrónico TEM FEI Tecnai 12 con filamento de LaB6 operado a 120 kV y dotado con cámara CMOS FEI Ceta (4kx4k). El equipo permite la realización de técnicas convencionales de microscopía, crioME y tomografía electrónica.
  • Criomicroscopio electrónico TEM/STEM Themofisher scientific Talos con cañón de emisión de campo (FEG) y equipado con detector directo de electrones Falcon III. El equipo permite la adquisición manual o automática de datos de crioME de alta resolución, criotomografía electrónica, tomografía TEM/STEM. (El equipo será instalado en Septiembre de 2020).
  • Microscopio Confocal Leica TCS SP5 equipado con 8 líneas laser y 4 canales espectrales de detección simultánea.
  • Equipo de criofijación automática Leica EM GP2.
  • Equipo de criofijación automática Thermofisher scientific Vitrobot Mark IV.
  • Equipo de criosustitución automática Leica EM AFS2.
  • Ultramicrotomo Leica
  • Ultramicrotomo LKB 2128 Ultratome.