Grupos de investigación - ENFERMEDADES INFECCIOSAS

Laboratorio de Referencia e Investigación en Resistencias a Antibióticos y Enfermedades Relacionadas con la Asistencia Sanitaria. Unidad de Referencia e Investigación en Resistencia a Antibióticos


Investigador responsable: Jesús Oteo Iglesias. jesus.oteo@isciii.es

Entidad: Instituto de Salud Carlos III. CNM

Investigadores:

  • María Belén Aracil García. CNM. ISCIII
  • Silvia García Cobos. CNM. ISCIII
  • María Dolores Pérez Vázquez. CNM. ISCIII
  • Detección y caracterización de mecanismos de resistencia a antibióticos emergentes, sobre todo a antibióticos de última línea como los antibióticos carbapenémicos y la colistina.
  • Caracterización y trazabilidad interregional, mediante el análisis de secuencias de genomas completos (WGS), de clones de alto riesgo con múltiple resistencia a antibióticos, y de plásmidos epidémicos portadores de genes de resistencia.
  • Identificación mediante recursos bio-informáticos de posibles dianas para el desarrollo de nuevos productos o moléculas relacionadas con el control de la resistencia a antibióticos (vacunas, pruebas diagnósticas, atenuantes de virulencia y otros).
  • Análisis de las tendencias evolutivas de la resistencia a antibióticos en patógenos bacterianos productores de bacteriemia; European Antimicrobial Resistance Surveillance Net (EARS-Net) del ECDC.
  • Caracterización mediante secuenciación de genomas completos de los principales clones de Klebsiella pneumoniae productores de carbapenemasas en España. Proyecto de Investigación en Salud ISCIII. Ministerio de Economía y competitividad. Vigencia: 2016-2018. Proyecto: PI15CIII/00017. IPs: Jesús Oteo, María Dolores Pérez. Se prolongó hasta 2019.
  • Incidencia y caracterización genómica de Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli productores de carbapenemasas aislados en hospitales españoles: Proyecto multicéntrico nacional CARB-ES-2019. Proyecto de Investigación en Salud ISCIII AESi 2018. Vigencia: 2019-2021. Proyecto: PI18CIII/00030. IP: Jesús Oteo.
  • National health care infrastructures, health care utilization and patient movements between hospitals: Networks working to improve surveillance (NeWIS). JPIAMR for transnational networks 2018. Vigencia 2019-2020. IP: Hajo Grundmann. IP en España: Jesús Oteo.
  • Plan Estratégico y de Acción para reducir el riesgo de selección y diseminación de la resistencia a los antimicrobianos. Encomienda de gestión de la Agencia Española del Medicamento y Productos Sanitarios al ISCIII. Vigencia: 2015-2017. IP: Jesús Oteo.
  • Population structure of multidrug resistant E. coli isolates from complicated urinary tract infections and their susceptibility to ceftolozane-tazobactam and other antimicrobial agents. Vigencia 2016-2017. Proyecto financiado por MSD. IPs: Juan Ignacio Alós, Jesús Oteo.
  • Survey of carbapenem- and/or colistin resistant Enterobacteriaceae (CCRE survey). Proyecto promovido por el ECDC. IP: ECDC. Coordinador responsable en España: Jesús Oteo, Belén Aracil.
  • Desarrollo preclínico de vacunas basadas en ADN plasmídico para la prevención de infecciones por Klebsiella pneumoniae y Acinetobacter baumannii multirresistentes. Proyecto de Investigación en Salud ISCIII AESi 2018. Vigencia: 2019-2021. Proyecto: PI18CIII/00018. IP: Michael McConnell, María Pérez Vázquez.
  • Impacto de la hospitalización en UCI en el microbioma y resistoma gastrointestinal, estudio de cohorte observacional. Proyecto Ayudas destinadas a la atracción de talento investigador CAM, 2018. Proyecto: CAM,2018-T1/BMD-11581; ISCII, MPY337/19. IP: Silvia García Cobos.
  • Análisis cuantitativo de la colonización intestinal por enterobacterias productoras de carbapenemasas. Proyecto de Investigacion en Salud AES 2017. Vigencia:2017-2019. IP: Jesús Mingorance, IC: Belén Aracil.
  • Pérez-Vázquez M, Sola-Campoy PJ, Zurita ÁM, et al. Carbapenemase-producing Pseudomonas aeruginosa in Spain: interregional dissemination of the high risk-clones ST175 and ST244 carrying blaVIM-2, blaVIM-1, blaIMP-8, blaVIM-20 and blaKPC-2 [published online ahead of print, 2020 May 22]. Int J Antimicrob Agents. 2020;106026. Q2, IF: 4,615.
  • Pérez-Vázquez M, Sola Campoy PJ, Ortega A, Bautista V et al. Emergence of NDM-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in Spain: phylogeny, resistome, virulence and plasmids encoding blaNDM-like genes as determined by WGS. J Antimicrob Chemother. 2019 Dec 1;74(12):3489-3496. Q1, IF: 5,217.
  • Pérez-Vazquez M, Oteo-Iglesias J, Sola-Campoy PJ, Carrizo-Manzoni H, et al. Characterization of Carbapenemase-Producing Klebsiella oxytoca in Spain, 2016-2017. Antimicrob Agents Chemother. 2019 May 24;63(6). Q1, IF : 4,715.
  • David S, Reuter S, Harris SR, Glasner C, et al. Epidemic of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in Europe is driven by nosocomial spread. Nat Microbiol. 2019 Nov;4(11):1919-1929. D1, IF: 14,3.
  • Grundmann H, Glasner C, Albiger B, et al. Occurrence of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in the European survey of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE): a prospective, multinational study. Lancet Infect Dis. 2017;17(2):153‐163. D1, IF: 27,516.
  • Técnicas generales de detección de sensibilidad a anitibióticos ( Difusión en agar disco-placa , Test de Epsilon o E-test y Microdilución. (AA-PT-001, Ed. 10).
  • Detección, amplificación y secuenciación de genes de resistencia (PCR clásica o Real-Time PCR).
  • Electroforesis de campo pulsado (PGFE) y MLST.
  • Secuenciación de genomas completos (Illumina, MinION).
  • Análisis bioinfómaticos de ensamblado, anotación, filogenia (SNPs, cgMLS), caracterización de genes de resistencia y virulencia, análisis y reconstrucción de plásmidos.

Equipo responsable de la coordinación de:

  • Red europea de vigilancia de la resistencia a antibióticos EARS-Net.
  • Red española de investigación en patología infecciosa REIPI.
  • Plan nacional contra la resistencia a antibióticos (PRAN).
  • Comité Coordinador de la red de laboratorios para la vigilancia de microorganismos resistentes.
  • Proyectos CARBA-ES-2019 (nacional) y CCRE-survey (ECDC).
  • Red del ECDC para el control de enfermedades bacterianas prevenibles mediante vacunación (patología invasiva H. influenzae).