• Variabilidad y evolución del virus HIV-1 en pacientes infectados. Relación con patogenia.
• Caracterización biológica del VIH en pacientes LTNPs, fundamentalmente de la envuelta viral.
• Mecanismos de control de la infección por VIH.
• Estudio de la persistencia del VIH-1 in vitro. Contribución de factores virales y celulares a la persistencia del virus.

Proyecto GLD22/00114: “Determination of factors associated with protection against Human Immunodeficiency VIrus type 1 Reinfection: Identification of protection correlates”. Investigador principal  María Pernas Escario. Duración 01/01/2023- 31/12/2024.  Financiación: 16.330 €. Gilead Sciences, S.L.

IMPACTO DE LA ENVUELTA EN EL CONTROL DE LA REPLICACIÓN DEL VIH: NUEVAS VÍAS PARA EL DISEÑO DE VACUNAS.  IPs: Concepción Casado y María Pernas. Organismo financiador: ISCIII-AESI 2020. Duración: 01/01/2021-31/12/2023. Financiación: 53.000 €. Nº de Expediente:  PI20CIII/000008

• Moyano A; Blanch-Lombarte O; Tarancon-Diez L; Pedreno-Lopez N; Arenas M; Alvaro T; Casado C; Olivares I; Vera M; Rodriguez C; Del Romero J; Lopez-Galindez C; Ruiz-Mateos El; Prado, JG; Pernas M. Immunoescape of HIV-1 in Env-EL9 CD8+T cell response restricted by HLA-B*14:02 in a Non progressor who lost twenty-seven years of HIV-1 control, Retrovirology. 2022; 19 (1): 6.
• Perez-Yanes S; Pernas M; Marfil S; Cabrera-Rodriguez R; Ortiz R; Urrea V; Rovirosa C; Estevez-Herrera J; Olivares I; Casado, C; Lopez-Galindez C; Blanco J; Valenzuela-Fernandez A. The Characteristics of the HIV-1 Env Glycoprotein Are Linked With Viral Pathogenesis, Frontiers in microbiology. 2022; 13: 763039.
• Casado C; Pernas M; Rava M; Ayerdi O; Vera M; Alenda R; Jimenez P; Docando F; Olivares I; Zaballos A; Vicario JL; Rodriguez C; Del Romero J; Lopez-Galindez C. High-Risk Sexual Practices Contribute to HIV-1 Double Infection Among Men Who Have Sex with Men in Madrid, AIDS RESEARCH AND HUMAN RETROVIRUSES. 2020; 36 (11): 896 - 904.
• Docando F; Casado C; Pernas M; Mota-Biosca A; Lopez-Galindez C; Olivares I. Characterizing the antiviral effect of an ATR inhibitor on human immunodeficiency virus type 1 replication, ARCHIVES OF VIROLOGY. 2020; 165 (3): 683 - 6905
• Casado, C; Galvez, C; Pernas, M; Tarancon-Diez L; Rodriguez C; Sanchez-Merino V; Vera M; Olivares I; De Pablo-Bernal R; Merino-Mansilla A; Del Romero J; Lorenzo-Redondo R; Ruiz-Mateos E; Salgado M; Martinez-Picado J; Lopez-Galindez C. Permanent control of HIV-1 pathogenesis in exceptional elite controllers: a model of spontaneous cure.Scientific reports. 2020, 10 (1): 1902. Tipo de soporte: Revista
• Ugarte A; Romero Y; Tricas A; Casado C; Lopez-Galindez C; Garcia F; Leal L. Unintended HIV-1 Infection During Analytical Therapy Interruption, The Journal of infectious diseases. 2020; 221 (10): 1740 – 1742.
• Cabrera-Rodriguez R; Hebmann V; Marfil S; Pernas M; Marrero-Hernandez S; Cabrera C; Urrea V; Casado, C; Olivares I; Marquez-Arce, D; Perez-Yanes S; Estevez-Herrera J; Clotet B; Espert L; Lopez-Galindez C; Biard-Piechaczyk M; Valenzuela-Fernandez A; Blanco J. HIV-1 envelope glycoproteins isolated from Viremic Non-Progressor individuals are fully functional and cytopathic, SCIENTIFIC REPORTS. 2019, 9: 5544.
• Lopez-Galindez C; Pernas M; Casado C; Olivares I; Lorenzo-Redondo R. Elite controllers and lessons learned for HIV-1 cure, Current opinion in virology. 2019; 38: 31 - 36.
• Casado C; Marrero-Hernandez S; Marquez-Arce D; Pernas M; Marfil S; Borras-Granana F; Olivares I; Cabrera-Rodriguez R; Valera MS; de Armas-Rillo L; Lemey P; Blanco J; Valenzuela-Fernandez A; Lopez-Galindez C. Viral Characteristics Associated with the Clinical Nonprogressor Phenotype Are Inherited by Viruses from a Cluster of HIV-1 Elite Controllers, MBIO. 2018; 9:  2
• Pernas M; Tarancon-Diez L; Rodriguez-Gallego E; Gomez J; Prado, JG; Casado C; Dominguez-Molina B; Olivares I; Coiras M; Leon A; Rodriguez C; Benito JM; Rallon N; Plana M; Martinez-Madrid O; Dapena M; Iribarren JA; Del Romero J; Garcia F; Alcami J; Muñoz-Fernandez MA; Vidal F; Leal M; Lopez-Galindez C; Ruiz-Mateos E. Factors Leading to the Loss of Natural Elite Control of HIV-1 Infection, Journal of virology. 2018; 92(5): e01805-17.

• Cultivos celulares de líneas establecidas y de “células mononucleares de sangre periférica” (PBMCs):
  • Ensayos de toxicidad celular.
  • Separación de PBMCs a partir de sangre (gradientes de ficoll).
• Infecciones celulares con virus VIH-1.
• Valoración de replicación viral:
  • Cuantificación de actividad retrotranscriptasa.
  • Ensayos para determinación de proteína p24.
  • Titulaciones de virus.
  • Inmunofluorescencia
• Detección y cuantificación de proteínas celulares por Western blot y Citometría de Flujo.
• Transfecciones
• Técnicas de PCR y secuenciación de ácidos nucleicos (Sanger y NGS).
• Técnicas de clonaje molecular.
• Mutagénesis dirigida.
• Programas informáticos para el análisis de secuencias nucleotídicas.
• Programas informáticos para estudios filogenéticos.

• Laboratorios para cultivos celulares con el nivel de seguridad requerido con cabinas de flujo laminar, incubadores, microscopios, contenedores de nitrógeno, etc.
• Laboratorio general de Biología Molecular equipado con centrifugas, termocicladores, equipos de electroforesis, etc.
• Laboratorio para diagnóstico de Retrovirus dotado de los equipos necesarios para el diagnóstico serológico, cabinas y aparatos de PCR.