• Alertas sanitarias producidas por Virus Respiratorios: Coronavirus SARS, Gripe aviar. Gripe humana y animal. Vigilancia virológica de su circulación.
• Antigripales y resistencias virales.
• Vacunas y efectividad vacunal.
• Virus respiratorios: Gripe, Coronavirus, Adenovirus, Metapneumovirus humano, Virus Respiratorio Sincitial, Parainfluenzavirus, Rinovirus, Bocavirus humano, Enterovirus respiratorios.
• Virus respiratorios emergentes: Gripe aviar, Coronavirus-MERS y Coronavirus-SARS, Enterovirus D-68.
• Diagnóstico y referencia de infecciones víricas respiratorias.
• Estudio del Viroma del tracto respiratorio: Nuevos métodos moleculares para la detección y caracterización de virus respiratorios.
• Biodefensa y virus respiratorios.
• Nuevos métodos serológicos aplicados a virología humana.
• Estructura y antigenicidad de proteínas de superficie de virus respiratorios.
• Proteómica de virus respiratorios.

1. Título del Proyecto: CLARITY-Causative Link between respirAtory syncytial viRus and chronic lung diseases: Identifying Targets for therapy.

   INVESTIGADORA PRINCIPAL de WP2: Inmaculada Casas. COORDINADORA WP2

   ENTIDAD FINANCIADORA: EU HORIZON-HLTH-2023-DISEASE-03/HORIZON-RIA/Grant number 101137201

   Inicio: 01/01/2024           HASTA: 31/12/2028                       Cuantía: 704.705,00 €.

2. Título del Proyecto: Bats as reservoirs of potentially emerging and re-emerging viruses: Search for new agents, study of infection susceptibility and evolutionary relationships.

   INVESTIGADOR PRINCIPAL: María Sonia Vázquez-Morón

   ENTIDAD FINANCIADORA: Ministerio de Ciencia e Innovación y de la Agencia Estatal de Investigación. PID2022-142608NB-I00. PROGRAMA: Generación de conocimiento 2022.

   Inicio: 01/09/2023           HASTA: 31/08/2027                       Cuantía: 150.000 €.

3. Título del Proyecto: Caracterización funcional y antigénica de variantes del SARSCoV-2 y de aislados de RSV postpandemia.

   INVESTIGADORA PRINCIPAL: Vicente Mas Lloret

   ENTIDAD FINANCIADORA: AESI-ISCIII PI22CII/00054.

   Inicio: 01/01/2023           HASTA: 31/12/2025                       Cuantía: 82000,00€.

4. Título del Proyecto: Consolidation of WGS and RT-PCR activities for SARS-CoV-2 in Spain towards sustainable use and integration of enhanced infrastructure and capacities in the RELECOV network

   INVESTIGADORA PRINCIPAL: Inmaculada Casas. COORDINADORA GENERAL

   ENTIDAD FINANCIADORA: EU4Health Programme (EU4H). Call: EU4H-2022-DGA-MS-IBA-1. RELECOV 2.0

   Project: 101113109

   Inicio: 01/07/2023           HASTA: 30/12/2025                       Cuantía: 2.200.421,27 €.

5. Título del Proyecto: Vaccine Effectiveness, Burden and Impact Studies (VEBIS) of COVID-19 and Influenza.

   INVESTIGADOR PRINCIPAL: Francisco Pozo. Lots 1, 2 and 5 Laboratory Coordination.

   ENTIDAD FINANCIADORA: ECDC-UE. Lot 1 nº 1 ECD.12616. Lot 2 nº 1 ECD.12609. Lot 5 nº 1 ECD.12850. Códigos ECDC: ECDC/2021/016, ECDC/2021/017 and ECDC/2021/019

   Inicio 19/10/2021   Fin 18/10/2025                                       Cuantía: 98.000,00 €

6. Título del proyecto: PI21CIII/00019-Infección respiratoria aguda en niños tras 2 años de pandemia de SARS-CoV-2: virus y respuesta inmune.

   INVESTIGADORA PRINCIPAL: Inmaculada Casas Flecha (Coordinadora)

   ENTIDAD FINANCIADORA: AESI-ISCIII. (Proyecto coordinado con subproyecto FIS PI21/00377 Impact of COVID-19 on respiratory viral infections, immune response and microbiota in the first year of life, including premature newborns. IP: Cristina Calvo 117.370,00€)

   Inicio: 01/01/2022           HASTA: 31/12/2024                       Cuantía: 111.000,00€.

7. Título del proyecto: Integración de la información genómica de SARS-CoV-2 y estudio del comportamiento antigénico de las nuevas variantes y linajes.

   INVESTIGADORA PRINCIPAL: Inmaculada Casas Flecha  

   ENTIDAD FINANCIADORA: Unión Española de Entidades Aseguradoras y Reaseguradoras- COVIDSEQ-UNESPA

   Inicio: 15-06-2022           HASTA: 31-12-2024                       Cuantía: 813.000,00€

8. Título del Proyecto: NEXTHREAT-Development of New Technologies to Track Emerging Infectious Threats in Wildlife and the Environment

   INVESTIGADOR PRINCIPAL: Miguel Ángel Jiménez Clavero. En el ISCIII Ana Vazquez

   ENTIDAD FINANCIADORA:  Agencia Estatal de Investigación. PLEC2021-007968.

   Inicio: 20/12/2021           HASTA: 19/12/2024

9. Título del proyecto: Desarrollo de kits diagnósticos mediante PCR multiplex en tiempo real en formato líquido y gelificado para detección enfermedades víricas y sepsis.

   INVESTIGADORA PRINCIPAL: Inmaculada Casas y Giovanni Fedele           

   ENTIDAD FINANCIADORA: Ministerio de Ciencia e Innovación y de la Agencia Estatal de Investigación. Retos-Colaboración 2019 (RTC2019-007023-1)

   Inicio: 11/06/2020           HASTA: 11/06/2024                       Cuantía: 403.302,25 (ISCIII)

   Participantes: Biotools biotechnological and Medical Laboratories S.A. 403.302,25€; Fundación Instituto Estudios Ciencias de la Salud-Castilla y Leon 126.208,80;  BIOLTY S.L. 270.864,00.         Cuantía total: 1.547.001,37€

Iglesias-Caballero M, Camarero-Serrano S, Varona S, Mas V, Calvo C, García ML, García-Costa J, Vázquez-Morón S, Monzón S, Campoy A, Cuesta I, Pozo F, Casas I.

Genomic characterisation of respiratory syncytial virus: a novel system for whole genome sequencing and full-length G and F gene sequences.

Euro Surveill. 2023 Dec;28(49).                               IF 19 INFECTIOUS DISEASES Q1/D1

Vázquez-Morón S, Iglesias-Caballero M, Lepe JA, Garcia F, Melón S, Marimon JM, García de Viedma D, Folgueira MD, Galán JC, López-Causapé C, Benito-Ruesca R, Alcoba-Florez J, Gonzalez-Candelas F, Toro MD, Fajardo M, Ezpeleta C, Lázaro F, Pérez-Castro S, Cuesta I, Zaballos A, Pozo F, Casas I, on behalf of RELECOV Network Members.

Enhancing SARS-CoV-2 Surveillance through Regular Genomic Sequencing in Spain: The RELECOV Network.

Int. J. Mol. Sci. 2023; 24(10):8573.                         IF 6,208  Biochemistry & Molecular Biology Q1

García-García ML, Pérez-Arenas E, Pérez-Hernández P, Falces-Romero I, Ruiz S, Pozo F, Casas I, Calvo C.

Human Metapneumovirus Infections during COVID-19 Pandemic, Spain.

Emerg Infect Dis. 2023 Apr;29(4):850-852.           IF 16,126 INFECTIOUS  9/95 Q1

García-García ML, Alcolea S, Alonso-López P, Martín-Martín C, Tena-García G, Casas I, Pozo F, Méndez-Echevarría A, Hurtado-Gallego J, Calvo C.

Antibiotic Utilization in Hospitalized Children with Bronchiolitis: A Prospective Study Investigating Clinical and Epidemiological Characteristics at a Secondary Hospital in Madrid (2004-2022).

Pathogens. 2023 Nov 28;12(12):1397.                  IF 3,7 MICROBIOLOGY Q2

del Rosal T, García-García ML, Casas I, Iglesias-Caballero M, Pozo F, Alcolea S, Bravo B, Rodrigo-Muñoz J, del Pozo V, Calvo C.

Torque Teno Virus in Nasopharyngeal Aspirate of Children With Viral Respiratory Infections.

Pediatr Infect Dis J. 2023; 42(3):p 184-188.         IF 3,806                 PEDIATRICS 31/130 Q1

García-García ML, Sastre B, Arroyas M, Beato M, Alonso P, Rodrigo-Muñoz J, del Pozo V, Casas I, Calvo C.

Nasal TSLP and periostin in infants with severe bronchiolitis and risk of asthma at 4 years of age.

Respir Res. 2023 Jan 24;24(1):26.                            IF 4,637  RESP SYSTEM 22/99 Q1

Rappazzo CG, Hsieh CL, Rush SA, Esterman ES, Delgado T, Geoghegan JC, Wec AZ, Sakharkar M, Mas V, McLellan JS, Walker IM.

Potently neutralizing and protective anti-human metapneumovirus antibodies target diverse sites on the fusion glycoprotein.

Immunity. 2022; 55: 1710-24 e8.                            IF 32,2 IMMUNOLOGY 2/161 D1

Li Y, Wang X, Broberg EK, Campbell H, Nair H and European RSV Surveillance Network.

Seasonality of respiratory syncytial virus and its association with meteorological factors in 13 European countries, week 40 2010 to week 39 2019.

Euro Surveill. 2022 Apr;27(16):2100619.              IF 21,286 INFECTIOUS DISEASES 5/95 Q1

Hsieh CL, Rush SA, Palomo C, Chou CV, P Wickens, Mas V, McLellan MI.

Structure-based design of prefusion-stabilized human metapneumovirus fusion proteins.

Nat Commun. 2022; 13: 1299                                  IF 16,6 MULTIDISCIPLINARY SCIENCES 6/73 D1

SÁNCHEZ GARCÍA L, PELLICER A, LÓPEZ-MARTÍNEZ C, GARCÍA-GARCÍA ML, CASAS I, POZO F, CALVO C. Respiratory morbidity associated with viral respiratory infections during neonatal stage in premature infants.

Pediatr Pulmonol. 2021 May;56(5):967-973.       IF 4,09 PEDIATRICS 21/130 Q1

• PCR en punto final.
• PCR en tiempo real-Sondas Taq Man.
• Secuenciación Sanger.
• Secuenciación Masiva de Virus Respiratorios en diferentes plataformas.
• Análisis filogenético de secuencias.
• Análisis filodinámico y filogeográfico.
• Análisis genotípico de resistencias a antigripales.
• Análisis fenotípico de resistencias a antigripales.
• Cultivos celulares de diferentes líneas.
• Cultivos de virus respiratorios.
• Inhibición de la Hemaglutinación.
• Neutralización de virus respiratorios.
• Análisis de anticuerpos neutralizantes de Virus Respiratorios.
• Mutagénesis dirigida.
• Expresión y purificación de proteínas virales.
• Análisis de interacciones mediante la tecnología “Surface Plasmon Resonance”.

El Laboratorio de Referencia e Investigación en Virus Respiratorios del CNM está acreditado según la norma ISO 15189. Consta de diferentes áreas de trabajo independientes con el resto de equipamiento requerido, área de preparación de mezclas de PCR, área de extracción, área de amplificación, área de preparación de las reacciones de secuenciación, área de geles de agarosa.

Equipación: análisis de muestras respiratorias mediante PCR en tiempo real y convencional. Extracción de ácidos nucleicos: 2 extractores automáticos. Cultivo de virus con cabinas de bioseguridad, microscopios invertidos, de fluorescencia, incubadores de CO2, centrífugas refrigeradas, contenedores de N2 líquido, neveras y congeladores de -80ºC. Equipos AKTA para cromatografía líquida de proteínas a alta velocidad.

El CNM dispone de una Unidad Común Científico-Técnica (UCCT) integrada por la Unidad de Genómica y la Unidad de Bioinformática Plataformas MiSeq y HiSeq de Illumina. Dispone de servicios: citómetro de flujo, Biacore X100, Unidad de imagen, microscopia confocal y microscopía electrónica, Unidad de recepción de muestras, Unidad de Garantía de la Calidad, Unidad de Bioseguridad y de un laboratorio de bioseguridad de nivel BSL3.

El Servicio de Pediatría del Hospital Severo Ochoa, cuenta con una planta de hospitalización pediátrica de 36 camas distribuida en zonas de lactantes, preescolares y escolares, que acoge niños de 0 a 14 años. Además cuenta con unidad neonatal que acoge recién nacidos hasta la edad de 1 mes CNM-ISCIII.