Grupos de investigación - ENFERMEDADES INFECCIOSAS

Laboratorio de Referencia e Investigación en Virus Respiratorios. Unidad de Detección y Referencia en Virus Respiratorios


Investigador responsable: Inmaculada Casas Flecha. icasas@isciii.es

Entidad: Instituto de Salud Carlos III. CNM

Investigadores:

  • Cristina Calvo Rey. Hospital Universitario La Paz
  • Olga Cano Morato. CNM. ISCIII
  • Isabel Cuesta de la Plaza. CNM. ISCIII
  • María de la Montaña Iglesias. CNM. ISCIII
  • Teresa Delgado Romero. CNM. ISCIII
  • María Luz García García. Hospital Universitario Severo Ochoa
  • Mónica González Esguevillas. CNM. ISCIII
  • Vicente Más Lloret. CNM. ISCIII
  • Mar Molinero Calamita. CNM. ISCIII
  • Gustavo Palacios Poggio. Instituto de Enfermedades Infecciosas del Ejército de EE.UU
  • Concepción Palomo Sanz. CNM. ISCIII
  • Francisco Pozo Sánchez. CNM. ISCIII
  • Mónica Vázquez Alcaraz. CNM. ISCIII
  • Alertas sanitarias producidas por Virus Respiratorios: Coronavirus SARS, Gripe aviar. Gripe humana y animal. Vigilancia virológica de su circulación.
  • Antigripales y resistencias virales.
  • Vacunas y efectividad vacunal.
  • Virus respiratorios: Gripe, Coronavirus, Adenovirus, Metapneumovirus humano, Virus Respiratorio Sincitial, Parainfluenzavirus, Rinovirus, Bocavirus humano, Enterovirus respiratorios.
  • Virus respiratorios emergentes: Gripe aviar, Coronavirus-MERS y Coronavirus-SARS, Enterovirus D-68.
  • Diagnóstico y referencia de infecciones víricas respiratorias.
  • Estudio del Viroma del tracto respiratorio: Nuevos métodos moleculares para la detección y caracterización de virus respiratorios.
  • Biodefensa y virus respiratorios.
  • Nuevos métodos serológicos aplicados a virología humana.
  • Estructura y antigenicidad de proteínas de superficie de virus respiratorios.
  • Proteómica de virus respiratorios.
  • Coordinación de actividades de investigación en el CNM para realizar una respuesta integradora frente a la pandemia por SARS-CoV2 en España. COV20/00679. 13/05/2020-12/05/2021. IP Coordinadora: Inmaculada Casas.
  • Multidisciplinary European network for research, prevention and control of the COVID-19 Pandemic ’-‘I-MOVE-COVID-19’ (‘action’). H2020-SC1-PHE-CORONAVIRUS-2020. UE. 16/03/2020-15/06/2022. IP subproyecto: Inmaculada Casas.
  • Ensayo clínico aleatorizado multicéntrico de terapia con plasma de convalecientes añadido al mejor tratamiento disponible para COVID-19 en pacientes hospitalizados. COV20/00072. 27/03/2020-27/10/2020. IP: Cristina Avendaño Solá y Rafael Duarte Palomino.
  • Desarrollo de kits diagnósticos mediante PCR multiplex en tiempo real en formato líquido y gelificado para detección enfermedades víricas y sepsis. RTC2019-007023-1-Retos-Colaboración 2019. 11/06/2020-11/06/2024.
  • Multicenter study of coronavirus disease 2019 (COVID-2019) in Solid Organ Transplant Recipients" IP: Elisa Cordero.
  • Estudio de la carga viral de SARS-CoV-2 en vías respiratorias y sangre como factor asociado al pronóstico de la COVID-19 en adultos. IP: Javier Sánchez.
  • Los virus respiratorios en las IRAs de recién nacidos y pacientes pediátricos: asociación con la gravedad del episodio agudo y con el desarrollo de asma y sibilancias recurrentes a largo plazo. ISCIII-Intramural - PI18CIII/00009. Proyecto coordinado con subproyecto PI18/00167 Infecciones virales respiratorias en recien nacidos de muy bajo peso, respuesta inmunologica e implicaciones pronosticas. 1/1/2019-31/12/2021. IP: Inmaculada Casas Flecha (coordinadora).
  • Asociación de los distintos perfiles del viroma, la microbiota y la respuesta inmune con la gravedad de la bronquiolitis viral aguda y con el desarrollo de sibilancias recurrentes. Universidad Alfonso X el Sabio y Santander Universidades. 1/1/2018-31/12/2020. IP: Maria Luz Garcia-Garcia.
  • Evolución paralela en virus y murciélagos ibéricos. Relación potencial con enfermedades emergentes. MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACIÓN- SAF2017-89355-P. 1/1/2018-31/12/2021. IP: Juan E. Echevarría.
  • Estudio y desarrollo de vacunas basadas en las proteínas F de los pneumovirus. INSTITUTO DE SALUD CARLOS III. MPY375/18. IP: Vicente Mas.
  • Olmedillas E, Cano O, Martinez I, Luque D, Terron MC, McLellan JS, Melero JA, Mas V. Chimeric Pneumoviridae fusion proteins as immunogens to induce cross-neutralizing antibody responses. EMBO Mol Med. 2018;10(2):175-87. DOI: 10.15252/emmm.201708078. IF: 10.624 / Medicine, Research & Experimental / D1.
  • Iglesias-Caballero M, Juste J, Vázquez-Morón S, Falcon A, Aznar-Lopez C, Ibáñez C, Pozo F, Ruiz G, Berciano JM, Garin I, Aihartza J, Echevarría JE, Casas I. New Adenovirus Groups in Western Palaearctic Bats. Viruses. 2018;10(8). pii: E443. doi: 10.3390/v10080443. IF: 3.811 / Virology / Q2.
  • Benavides-Nieto M, Méndez-Echevarría A, Del Rosal T, García-García ML, Casas I, Pozo F, de la Serna O, Lopez-Granados E, Rodriguez-Pena R, Calvo C. The role of respiratory viruses in children with humoral immunodeficiency on immunoglobulin replacement therapy. Pediatr Pulmonol. 2019;54(2):194-199. doi: 10.1002/ppul.24214. IF: 2.534 / Pediatrics / Q2.
  • Pérez-Sautu U, Wiley MR, Iglesias-Caballero M, Pozo F, Prieto K, Chitty JA, García-García ML, Calvo C, Casas I, Palacios G. Target-independent high-throughput sequencing methods provide evidence that already known human viral pathogens play a main role in respiratory infections with unexplained etiology. Emerg Microbes Infect. 2019;8(1): 1054-1065. doi: 10.1080/22221751.2019.1640587. PMID: 31335277. IF: 5,776 / Microbiology / Q1.
  • Vela M, Del Rosal T, Pérez-Martínez A, Valentín J, Casas I, Pozo F, Reinoso-Barbero F, Bueno D, Corral D, Méndez-Echevarría A, Mozo Y, Calvo C. Possible role of highly activated mucosal NK cells against viral respiratory infections in children undergoing haematopoietic stem cell transplantation. Sci Rep. 2019;9(1):18792. doi: 10.1038/s41598-019-55398-y. PMID: 31827202. IF: 3,998 / Multidisciplinary Sciences / Q1.
  • PCR en punto final.
  • PCR en tiempo real-Sondas Taq Man.
  • Secuenciación Sanger.
  • Secuenciación Masiva de Virus Respiratorios en diferentes plataformas.
  • Análisis filogenético de secuencias.
  • Análisis filodinámico y filogeográfico.
  • Análisis genotípico de resistencias a antigripales.
  • Análisis fenotípico de resistencias a antigripales.
  • Cultivos celulares de diferentes líneas.
  • Cultivos de virus respiratorios.
  • Inhibición de la Hemaglutinación.
  • Neutralización de virus respiratorios.
  • Análisis de anticuerpos neutralizantes de Virus Respiratorios.
  • Mutagénesis dirigida.
  • Expresión y purificación de proteínas virales.
  • Análisis de interacciones mediante la tecnología “Surface Plasmon Resonance”.

El Laboratorio de Referencia e Investigación en Virus Respiratorios del CNM está acreditado según la norma ISO 15189. Consta de diferentes áreas de trabajo independientes con el resto de equipamiento requerido, área de preparación de mezclas de PCR, área de extracción, área de amplificación, área de preparación de las reacciones de secuenciación, área de geles de agarosa.

Equipación: análisis de muestras respiratorias mediante PCR en tiempo real y convencional. Extracción de ácidos nucleicos: 2 extractores automáticos. Cultivo de virus con cabinas de bioseguridad, microscopios invertidos, de fluorescencia, incubadores de CO2, centrífugas refrigeradas, contenedores de N2 líquido, neveras y congeladores de -80ºC. Equipos AKTA para cromatografía líquida de proteínas a alta velocidad.

El CNM dispone de una Unidad Común Científico-Técnica (UCCT) integrada por la Unidad de Genómica y la Unidad de Bioinformática Plataformas MiSeq y HiSeq de Illumina. Dispone de servicios: citómetro de flujo, Biacore X100, Unidad de imagen, microscopia confocal y microscopía electrónica, Unidad de recepción de muestras, Unidad de Garantía de la Calidad, Unidad de Bioseguridad y de un laboratorio de bioseguridad de nivel BSL3.

El Servicio de Pediatría del Hospital Severo Ochoa, cuenta con una planta de hospitalización pediátrica de 36 camas distribuida en zonas de lactantes, preescolares y escolares, que acoge niños de 0 a 14 años. Además cuenta con unidad neonatal que acoge recién nacidos hasta la edad de 1 mes CNM-ISCIII.