• Diagnóstico, referencia y caracterización molecular de los parásitos Toxoplasma gondii y protozoos intestinales que originan enfermedades autóctonas, importadas y emergentes. Relación con la clínica, epidemiología (zoonosis, brotes) y control.
• Epidemiología molecular de protistas entéricos causantes de diarrea en países de renta baja y alta.
• Diagnóstico sindrómico de agentes víricos, bacterianos y parasitarios causantes de enfermedad gastrointestinal en el laboratorio clínico.
• Zoonosis y transmisión simpátrica. El papel de los animales de producción, domésticos y de vida libre como reservorios de enfermedad humana por patógenos causantes de enfermedad gastrointestinal.
• Los protistas entéricos como patobiontes. Interacción entre agentes causantes de diarrea y la microbiota del hospedado.
• Detección y caracterización de amebas y amebas de vida libre patógenas (Entamoeba histolytica Acanthamoeba, Naegleria fowleri, Balamuthia mandrillaris) causantes de enfermedades sistémicas, neurológicas y oculares emergentes. Estudio de fuente de contaminación hídrica y medioambiental.

Toxoplasmosis congénita en España: Estudio colaborativo multidisciplinar sobre la situación epidemiológica actual, retos y propuestas de mejora en prevención y diagnóstico. IP: Isabel de Fuentes. Organismo financiador: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, ISCIII FIS AESI. Proyecto de Investigación de Salud. Duración: diciembre 2021- diciembre 2024, Financiación: 90.500 €. Nº de expediente: PI21CIII/00031

Paving the way for implementing a syndromic diagnostic scheme at the CNM for the diagnosis of diarrhoea-causing pathogens in stool samples based on molecular and metagenomics methods. IP: David Carmena, Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, ISCIII FIS AESI. Proyecto de Investigación de Salud. Duración: 2020-2023, Financiación: 93.200 €. Nº de expediente: PI19CIII/00029

Relación de la infección latente por Toxoplasma gondii con los trastornos mentales y del comportamiento. Educación para la salud. IP: David González Barrio. Plan de consolidación de la investigación del IMIENS 2022. Duración: 2022-2024. Financiación: 4000 €

Blastocystis under One Health. IP: Anastasios D. Tsaousis European Cooperation in Science and Technology (COST Action Code CA21105), Duración: 2022-2026, Financiación: 500.000 €

Antibiotics, hormones, persistent and mobile organic contaminants and pathogens, the complex mixture in agriculture and livestock scenario. Risk to health or natural attenuation?” IP: Raffaella Meffe y  Ana de Santiago Martín. (PID2020-118521RB-I00Exp: PID2020-118521RB-100 Proyectos I+D+i 2020 - Modalidad «Retos Investigación», Ministerio de Ciencia e Innovación, Duración: 2021-2025, Financiación: 195.700 €

Capacity building towards the implementation of an EcoHealth framework in Northern Mozambique. IP: Eduardo Ferreira, Fundação para a Ciência e a Tecnologia  (Portugal) (Ref.: FCT-AGAKHAN / 541698804 / 2019 Aga Khan Development Network. Duración: 2021-2023, Financiación: 249.987 €

Monitorización de las principales zoonosis en pequeños carnívoros. IP: Marta Mateo Barrientos. Organismo financiador: Universidad Alfonso X el Sabio. Fundación Universidad Alfonso X el Sabio- Banco Santander XI Convocatoria de Ayudas para grupos de Investigación, Desarrollo e Innovación Santander-UAX. Duración:  2020-2022. Financiación: 30.000 €. Nº de Expediente: 1.011.019

Enfermedades tropicales: Prevención y control de enfermedades tropicales importadas y reemergentes de elevado impacto. Red RICET: Redes temáticas de investigación cooperativa en salud (RETICS): Red de Investigación Cooperativa en Enfermedades Tropicales (RICET). IP Coordinador:  A. Benito. Organismo financiador: Fondo Europeo de Desarrollo Regional. Fondo de Investigación Sanitaria. Duración:  2012 – 2016/ 2017-2022. Nº de Expediente: RD12/0018/0001.  

-Casulli A, Abela-Ridder B, Petrone D, Fabiani M, Bobić B, Carmena D, Šoba B, Zerem E, Gargaté MJ, Kuzmanovska G, Calomfirescu C, Rainova I, Sotiraki S, Lungu V, Dezsényi B, Herrador Ortiz Z, Karamon J, Maksimov P, Oksanen A, Millon L, Sviben M, Shkjezi R, Gjoni V, Akshija I, Saarma U, Torgerson P, Snabel V, Antolova D, Muhovic D, Besim H, Chereau F, Belhassen García M, Chappuis F, Gloor S, Stoeckle M, Müllhaupt B, Manno V, Santoro A, Santolamazza F.Unveiling the incidences and trends of the neglected zoonosis cystic echinococcosis in Europe: a systematic review from the MEME project. Lancet Infectious Diseases, en prensa. IF: 71,421. D1

-Estévez RM, Fuentes I, Carmona R, Cano R. Toxoplasmosis in Spain, analysis of hospitalizations during the period 1997-2018. Rev Esp Salud Publica. 2021 Dec 17;95:e202112194 (1-11).

- Köster PC, Martínez-Nevado E, González A, Abelló-Poveda MT, Fernández-Bellon H, de la Riva-Fraga M, Marquet B, Guéry JP, Knauf-Witzens T, Weigold A, Dashti A, Bailo B, Imaña E, Muadica AS, González-Barrio D, Ponce-Gordo F, Calero-Bernal R, Carmena D. 2022. Intestinal protists in captive non-human primates and their handlers in six European zoological gardens. Molecular evidence of zoonotic transmission. Frontiers in Veterinary Science, 8:819887. IF: 5,005. D1

-Muadica AS, Balasegaram S, Beebeejaun K, Köster PC, Bailo B, Hernández-de-Mingo M, Dashti A, Dacal E, Saugar JM, Fuentes I, Carmena D. 2021. Risk factors for intestinal parasites in symptomatic and asymptomatic schoolchildren in central Mozambique. Clinical Microbiology and Infection, 27: 624-629. IF: 7,117. D1

-Rivero-Juarez A, Dashti A, Santín M, Köster PC, Lopez-Lopez P, Risalde MA, García-Bocanegra I, Gomez-Villamandos JC, Caballero-Gómez J, Frías M, Bailo B, Ortega S, Muadica AS, Calero-Bernal R, González-Barrio D, Rivero A, Briz V, Carmena D. 2021. Diarrhoea-causing enteric protist species in intensively and extensively raised pigs (Sus scrofa domesticus) in Southern Spain. Part II: Association with Hepatitis E virus susceptibility. Transboundary and Emerging Diseases, 69:e1172-e1178. IF: 5,005. D1

-Messa Jr. A, Köster PC, Garrine M, Vubil D, Acácio S, Nhampossa T, Massora S, Cossa A, Kotloff K, Levine MM, Alonso P, Gilchrist c, Bartelt L, Carmena D, Mandomando I. 2021. Molecular characterization of Giardia duodenalis in children under 5 years from the Manhiça district, Southern Mozambique enrolled in a matched case-control study on the etiology of diarrhea. PLoS Neglected Tropical Diseases, 15(1):e0008987. IF: 3,885. D1

-Muadica AS, Messa Jr., AE, Dashti A, Santin M, Manjate F, Chirinda P, Garrine M, Vubil D, Acácio S, Köster PC, Bailo B, Nhampossa T, Calero-Bernal R, Mwenda J, Mandomando I, Carmena D. 2020. First identification of genotypes of Enterocytozoon bieneusi (Microsporidia) among symptomatic and asymptomatic children in Mozambique. PLoS Neglected Tropical Diseases, 14(6):e0008419.  IF: 3,884. D1

-Noordin R, Yunus MH, Saidin S, Mohamed Z, Fuentes I, Rubio JM, Golkar M, Hisam S, Lee R, Mahmud R. 2020 Multi-Laboratory Evaluation of a Lateral Flow Rapid Test for Detection of Amebic Liver Abscess. Am J Trop Med Hyg. 103:2233-2238. IF: 3,08, Q2

-Calero-Bernal R, Horcajo P, Hernández M, Ortega-Mora LM, Fuentes I. 2019. Absence of Neospora caninum DNA in Human Clinical Samples, Spain. Emerg Infect Dis. 25:1226-1227. IF: 7,485, Q1, D1.

-Montoya A, Miró G, Saugar JM, Fernández B, Checa R, Gálvez R, Bailo B, Marino V, Piñero JE, Valladares B, Lorenzo-Morales J, Fuentes I. 2019 Detection and molecular characterization of Acanthamoeba spp. in stray cats from Madrid, Spain. Exp Parasitol. 188:8-12 pii: S0014-4894(17)30642 IF: 2,142, Q2

• Métodos de diagnóstico parasitológico y aislamiento: técnicas de concentración, identificación microscópica, aislamiento en cultivos, bioensayo y aislamiento en animales de experimentación. Criopreservación.
• Métodos inmunológicos: técnicas de detección de anticuerpos específicos (Western-blot, Inmunofluorescencia indirecta (IFI), ELISA, ELFA), técnicas de detección de antígenos de parásitos (ELISA-Ag, Inmunocromatográfía rápida, inmunofluorescencia directa (IFD), técnicas inmunomagnéticas).
• Métodos moleculares: Diversas técnicas de extracción de ADN, PCR, PCR-nested, PCR-semi-nested, PCR-multiplex,  PCR en tiempo real,  análisis de RFLPs, secuenciación.
• Métodos de análisis de secuencias y estudio filogenético (programas BLAST, BioEdit, Chromas, MEGA, etc.).
• Métodos de análisis estadísticos: Bases de datos (Excel, Access, etc.), programas estadísticos (Epi info, EpiData, etc.).

El grupo dispone de un espacio propio de laboratorio dentro del laboratorio general del Laboratorio de Referencia e Investigación de Parasitología (LRIP), y comparte los diversos laboratorios comunes que dispone el LRIP: laboratorio de manejo y procesamiento de muestras con equipamiento adecuado (campanas de bioseguridad, cabinas de flujo, centrífugas, etc.), laboratorio de aislamiento y cultivo de parásitos, laboratorio de preparación de medios, laboratorio libre de ADN (pre-PCR), laboratorio de termocicladores, laboratorio post-PCR y electroforesis, cámaras de -20 oC y de +4 oC, cámara a 28 oC para cultivos, cuartos de almacenamiento de reactivos, salas de reuniones, entre otros medios.

Dispone de todos los equipos importantes necesarios para la realización de las técnicas y procesos desarrollados en sus líneas de investigación: Microscopios óptico, de fluorescencia e invertido, lector de ELISA, balanzas y balanzas de precisión, estufas, cabinas de seguridad biológica, cabinas de flujo, gases y olores, laboratorio de cultivos, neveras y congeladores (-20 oC, -80 oC), agitadores, centrífugas y ultracentrífugas, pipetas y micropipetas, robots de extracción de ADN, diferentes espacios para la realización de las diversas etapas de la técnica de PCR para evitar problemas de contaminación, termocicladores convencionales y termocicladores a tiempo real, termobloques, fuentes de alimentación, sistemas de electroforesis, sistemas de esterilización, sistema de visualización de productos de amplificación, Nanodrop, varios ordenadores con acceso a los diversos programas y a diferentes bases de datos, como GenBank y EMBL entre otras, para poder desarrollar su trabajo.

También cuenta con el apoyo de otras Unidades comunes y Servicios del Centro Nacional de Microbiología, como la unidad de Genómica, con el servicio de secuenciación y bioinformática, el Laboratorio de Seguridad Biológica P3, el Microscopio electrónico y Microscopio confocal, el animalario con el grupo de la unidad de veterinaria, orientación diagnóstica, unidad de calidad, biblioteca, etc. que apoyan la actividad investigadora, de referencia y apoyo al Sistema Nacional de Salud.