Grupos de investigación - ENFERMEDADES INFECCIOSAS

Laboratorio de Referencia e Investigación en Parasitología. Unidad de Toxoplasmosis y Protozoos Intestinales.


Investigador responsable: Isabel de Fuentes Corripio. ifuentes@isciii.es

Entidad: Instituto de Salud Carlos III. CNM

Investigadores:

  • Begoña Bailo Barroso. CNM. ISCIII
  • David Carmena Jiménez. CNM. ISCIII
  • Alejandro Dashti Arrebola. UCM
  • David González Barrio. CNM. ISCIII
  • Carolina Hernández Castro. UCM
  • Elena Imaña Perrella. CAM
  • Pamela Carolina Köster Cavicchioli. UCM
  • Marina Navarro Alonso. UCM
  • Aly Salimo Muadica. UCM
  • Diagnóstico, referencia y caracterización molecular de los parásitos Toxoplasma gondii y protozoos intestinales que originan enfermedades autóctonas, importadas y emergentes. Relación con la clínica, epidemiología (zoonosis, brotes) y control.
  • Epidemiología molecular de protistas entéricos causantes de diarrea en países de renta baja y alta.
  • Diagnóstico sindrómico de agentes víricos, bacterianos y parasitarios causantes de enfermedad gastrointestinal en el laboratorio clínico.
  • Zoonosis y transmisión simpátrica. El papel de los animales de producción, domésticos y de vida libre como reservorios de enfermedad humana por patógenos causantes de enfermedad gastrointestinal.
  • Los protistas entéricos como patobiontes. Interacción entre agentes causantes de diarrea y la microbiota del hospedado.
  • Detección y caracterización de amebas y amebas de vida libre patógenas (Entamoeba histolytica Acanthamoeba, Naegleria fowleri, Balamuthia mandrillaris) causantes de enfermedades sistémicas, neurológicas y oculares emergentes. Estudio de fuente de contaminación hídrica y medioambiental.
  • Enfermedades tropicales: Prevención y control de enfermedades tropicales importadas y reemergentes de elevado impacto. Red RICET: Redes temáticas de investigación cooperativa en salud (RETICS): Red de Investigación Cooperativa en Enfermedades Tropicales (RICET). Entidad Financiadora: Fondo Europeo de Desarrollo Regional. Fondo de Investigación Sanitaria (FIS) (RD12/0018/0001) (2012 – 2016/ 2017-220). Investigador Principal Coordinador: A. Benito.
  • Paving the way for implementing a syndromic diagnostic scheme at the CNM for the diagnosis of diarrhoea-causing pathogens in stool samples based on molecular and metagenomics methods, (Exp. PI19CIII/00029) Entidad Financiadora: AESI, Instituto de Salud Carlos III (2019-2021) Investigador Principal: D. Carmena.
  • Detección y caracterización molecular de los protozoos emergentes de carácter zoonósico Cryptosporidium sp., Giardia duodenalis y Toxoplasma gondii en muestras animales y medioambientales (Cod.1.010.912) Entidad Financiadora: Fundación Universidad Alfonso X “El Sabio”- Banco Santander. X Convocatoria Proyectos de Investigación Santander-UAX. (2019-2020) Investigador Principal: A. Montoya.
  • Calero-Bernal R, Horcajo P, Hernández M, Ortega-Mora LM, Fuentes I. Absence of Neospora caninum DNA in human clinical samples, Spain. Emerg Infect Dis. 2019;25:1226-1227. IF: 7,485, (Q1, D1).
  • Reh L, Salimo-Muadica A, Köster PC, Balasegaram S, Verlander NQ, Ruiz-Chércoles E, Carmena D. Substantial prevalence of protist enteroparasites Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis and Blastocystis sp. in asymptomatic school children in Leganés, Madrid (Spain), November 2017-June 2018. Euro Surveillance. 2019;24(43). IF: 7,400 (Q1, D1).
  • Muadica AS, Balasegaram S, Beebeejaun K, Köster PC, Bailo B, Hernández-de-Mingo M, Dashti A, Dacal E, Saugar JM, Fuentes I, Carmena D. Risk factors for intestinal parasites in symptomatic and asymptomatic schoolchildren in central Mozambique. Clin Microbiol Infect. 2020; doi: 10.1016/j.cmi.2020.05.031. IF: 6,425 (Q1, D1).
  • Rivero-Juarez A, Dashti A, Muadica AS, Köster PC, Bailo B, Hernández de Mingo M, Dacal E, Saugar JM, Calero-Bernal R, González D, Briz V, Carmena D. Hepatitis E virus and protist enteroparasite co-transmission between sympatric wild boar (Sus scrofa ferus) and Iberian pig (Sus scrofa domesticus) populations in Southern Spain. Parasit Vectors. 2020;13(1):281. IF: 3,031 (Q1, D1).
  • Calero-Bernal R, Pérez-Martín JE, Reina D, Serrano FJ, Frontera E, Fuentes I, Dubey JP. Detection of zoonotic protozoa Toxoplasma gondii and Sarcocystis suihominis in wild boars from Spain. Zoonoses Public Health. 2016;63(5):346-350. IF: 2,323 (Q1,D1).
  • Métodos de diagnóstico parasitológico y aislamiento: técnicas de concentración, identificación microscópica, aislamiento en cultivos, bioensayo y aislamiento en animales de experimentación. Criopreservación.
  • Métodos inmunológicos: técnicas de detección de anticuerpos específicos (Western-blot, Inmunofluorescencia indirecta (IFI), ELISA, ELFA), técnicas de detección de antígenos de parásitos (ELISA-Ag, Inmunocromatográfía rápida, inmunofluorescencia directa (IFD), técnicas inmunomagnéticas).
  • Métodos moleculares: Diversas técnicas de extracción de ADN, PCR, PCR-nested, PCR-semi-nested, PCR-multiplex,  PCR en tiempo real,  análisis de RFLPs, secuenciación.
  • Métodos de análisis de secuencias y estudio filogenético (programas BLAST, BioEdit, Chromas, MEGA, etc.).
  • Métodos de análisis estadísticos: Bases de datos (Excel, Access, etc.), programas estadísticos (Epi info, EpiData, etc.).

El grupo dispone de un espacio propio de laboratorio dentro del laboratorio general del Laboratorio de Referencia e Investigación de Parasitología (LRIP), y comparte los diversos laboratorios comunes que dispone el LRIP: laboratorio de manejo y procesamiento de muestras con equipamiento adecuado (campanas de bioseguridad, cabinas de flujo, centrífugas, etc.), laboratorio de aislamiento y cultivo de parásitos, laboratorio de preparación de medios, laboratorio libre de ADN (pre-PCR), laboratorio de termocicladores, laboratorio post-PCR y electroforesis, cámaras de -20 oC y de +4 oC, cámara a 28 oC para cultivos, cuartos de almacenamiento de reactivos, salas de reuniones, entre otros medios.

Dispone de todos los equipos importantes necesarios para la realización de las técnicas y procesos desarrollados en sus líneas de investigación: Microscopios óptico, de fluorescencia e invertido, lector de ELISA, balanzas y balanzas de precisión, estufas, cabinas de seguridad biológica, cabinas de flujo, gases y olores, laboratorio de cultivos, neveras y congeladores (-20 oC, -80 oC), agitadores, centrífugas y ultracentrífugas, pipetas y micropipetas, robots de extracción de ADN, diferentes espacios para la realización de las diversas etapas de la técnica de PCR para evitar problemas de contaminación, termocicladores convencionales y termocicladores a tiempo real, termobloques, fuentes de alimentación, sistemas de electroforesis, sistemas de esterilización, sistema de visualización de productos de amplificación, Nanodrop, varios ordenadores con acceso a los diversos programas y a diferentes bases de datos, como GenBank y EMBL entre otras, para poder desarrollar su trabajo.

También cuenta con el apoyo de otras Unidades comunes y Servicios del Centro Nacional de Microbiología, como la unidad de Genómica, con el servicio de secuenciación y bioinformática, el Laboratorio de Seguridad Biológica P3, el Microscopio electrónico y Microscopio confocal, el animalario con el grupo de la unidad de veterinaria, orientación diagnóstica, unidad de calidad, biblioteca, etc. que apoyan la actividad investigadora, de referencia y apoyo al Sistema Nacional de Salud.